文章目录

  • 前言
  • 一、OpenMPI是什么？
  • 二、OpenMPI与OpenMP的区别
  • 三、 OpenMPI的编译安装
  • 四、OpenMPI的使用示例
  • 总结

前言

OpenMPI是一个开源的消息传递接口（Message Passing Interface，MPI）的实现，用于并行计算。它允许多个计算节点之间进行通信和数据交换，从而实现分布式计算。这里介绍OpenMPI的安装和基本使用。安装是后续的分子对接虚拟筛选以及分子动力学研究的准备工作。

一、OpenMPI是什么？


OpenMPI（Open Message Passing Interface）是一个开源的并行计算库，用于在集群计算环境中进行并行计算。它采用消息传递编程模型，可以在多个计算节点之间进行高效的数据通信和同步操作。

OpenMPI支持多种并行计算的应用场景，包括科学计算、机器学习、数据分析等。它提供了一组丰富的函数接口，可以实现进程间的消息传递和同步操作。用户可以通过调用这些函数来编写并行程序，利用集群中的多个计算节点进行并行计算。

OpenMPI的设计目标是提供一个高性能、可扩展、可移植的并行计算库。它可以在各种操作系统和硬件平台上运行，并具有良好的可移植性。OpenMPI支持多种传输协议，包括TCP/IP、InfiniBand、Myrinet等，可以适应不同的网络环境。

OpenMPI还提供了一些高级功能，如动态进程管理、进程互操作等。动态进程管理允许用户在运行时动态添加或删除计算节点，从而实现动态扩展计算资源。进程互操作允许不同的并行计算库之间进行互操作，实现资源共享和任务协同。

总之，OpenMPI是一个功能强大的并行计算库，可以帮助用户更好地利用集群计算资源进行并行计算。它是科学计算和大规模数据处理领域的重要工具，被广泛应用于各种科学研究和工程实践中。

二、OpenMPI与OpenMP的区别

OpenMPI和OpenMP是两个不同的并行计算框架。

OpenMPI是一种消息传递接口（Message Passing Interface），它能够在分布式内存系统中实现进程间的通信。OpenMPI可以用于在多台计算机上进行并行计算，每个计算节点都有自己的内存和处理器。OpenMPI通过消息传递的方式将数据交换在不同的计算节点之间，从而实现并行计算。

OpenMP则是一种共享内存接口，它能够在共享内存系统中实现线程间的并行计算。OpenMP适用于单个计算节点上的并行计算，多个线程可以共享同一个内存空间。OpenMP通过将计算