3.RT Structure 文件批量转.nii

RT Structure 文件批量转.nii程序

1.目的

将RT Structure文件转换成.nii文件

2.病例文件结构示例

导出的数据应该包括病人的dcm原始CT图像以及RTstruct文件，结构目录如下：

3. 处理流程

参考开源的 dcmrtstruct2nii 工具包，pip 安装后，修改部分源代码 。以解决dcm文件不能读取以及是否保存文件到磁盘的问题。

1.安装dcmrtstruct2nii包

pip install dcmrtstruct2nii 

2. 官网使用教程

from dcmrtstruct2nii import dcmrtstruct2nii, list_rt_structs
path = './StrctrSets.dcm'  # RT结构文件所在的路径
print(list_rt_structs(path))
dcmrtstruct2nii(path, './test', './outputa') #分别对应rtstruct.dcm,病人图像文件夹，输出文件夹

###3.示例文件夹数据批量转换代码
下面展示一些 内联代码片。

from dcmrtstruct2nii import dcmrtstruct2nii, list_rt_structs
import SimpleITK as sitk
import os

data_p