Conf

为了方便大家体验分子 3D 稳定构象生成工具,Conf-GEM 已在 Bohrium Apps 上线:(/apps/conf-gem-web)。目前,Conf-GEM 限时免收取 license 费用。下面,我们简单介绍一下 Conf-GEM 的使用流程:

1.登录 Bohrium 账号,并进入网页中的预测工具(/apps/conf-gem-web)

2.上传需要生成分子稳定 3D 构象的分子文件,包括两种输入形式:

a.输入上传单个分子。可以直接输入单个分子的简化分子线性输入规范(SMILES)字符串。

b.输入批量分子的文件。可以以文本文件的格式列出多个分子的 SMILES 结构,同时为每个分子自定义命名。

3.选择要生成的构象数(最大支持50个构象)

4.点击提交按钮进行在线生成

5.查看生成结果

选中 1 2 号分子进行叠合