2024年3月26日发(作者:)

4

垫亲点

43

卷第

1

专题综述

doi:10.3969/.0253-9608.2021.01.007

G

蛋白偶联受体的共同激活机制

周庆同

戴之卓

②③

赵素文

②③丫

①复旦大学基础医学院

上海

200032

:②上海科技大学

iHuman

研究所

上海

201210

:③上海科技大学生命科

学与技术学院

上海

201210

摘要

G

蛋白偶联受体

(G

protein-coupled

receptor,

GPCR

)

构成人体中最庞大的膜蛋白家族

也是最重要的一类药物靶

随着

GPCR

结构解析技术的突破

目前已破解八十余个受体的

400

多个结构

揭示出

GPCR

复杂多样的配体结合模式和

跨膜信号转导机制

近年来

残基相互作用计算已实现对

GPCR

构象变化的精细描述

揭示出

A

家族

GPCR

存在共同的激活

机制

文章简要回顾

GPCR

激活机制研究的方法和创新点

并对

A

家族

GPCR

共同激活机制如何推动功能研究和药物研发进

行展望

关键词

G

蛋白偶联受体

激活机制

别构调控

药物开发

G

蛋白偶联受体

(

G

protein-coupled

receptor,

GPCR

)

是人体内最大的一类细胞信号转导受体家

几乎参与所有生命活动

,负责调控细胞对光

线

气味

激素

神经递质

趋化因子等的应答

对维持生命健康具有非常重要的意义

1-2

GPCR

(

N-terminus

)

胞内

端(

C-terminus

)

3

个胞外环

(

extracellular

loops

)

3

个胞内环

(

intracellular

loops

)□

GPCR

的胞外区域在结合

激动性信号分子(如气味

激素

神经递质

重要性使其成为最重要的药物靶标家族之一

心血管疾病

代谢性疾病

神经相关性疾病

疫性疾病和癌症等重大疾病的药物研发中扮演着重

要的角色

目前靶向

GPCR

的药物约

500

FDA

已批准药物的

34%

3-4

基于序列相似性

人类的

800

多个

GPCR

可被分为

4

个亚家族

分别是视紫红

化因子)后发生构象变化

进而引发跨膜螺旋

的运动

特别是第

6

跨膜螺旋靠近胞内的那部分

(

intracellular

half

of

TM6

)

往外翘起

此时激活

受体的胞内区域可招募并结合下游效应蛋白(如

G

蛋白

P-arrestin

等)

这些效应蛋白通过环腺

苷酸

(

cAMP

)信号通路

磷脂酰肌醇信号通路

和钙离子信号通路等调节体内生理活动

质受体

(

A

家族)

分泌素受体和黏附受体

(

B

族)

代谢型谷氨酸受体

(

C

家族)

卷曲受体

(

F

家族)

其中

A

家族的受体个数最多(超过

700

个)

生理功能也最为多样

目前

GPCR

研究已获

10

次诺贝尔奖

这也从侧面说明它的重要性叫

GPCR

具有保守的结构特征

7

个跨膜螺

GPCR

的激活机制是理解其生理功能及相关

疾病成因的必由之路

也是药物精准研发的基

并一直是该领域研究的核心内容和前沿热

[6-7

GPCR

的激活机制研究多关注于单个受

(

seven

transmembrane

helices,

7TMs

)

7

个螺旋组成的跨膜结构域将受体分割为胞外

N

体或个别位点

所揭示的激活机制缺乏家族层面

的系统总结

目前

伴随着新的激活现象和特征

的发现

人们对受体激活机制的传统认识正不断

被突破

丫通信作者

研究方向

蛋白质序列-结构-功能关系的计算生物学

E-mail:

***********************.cn

45

Chinese

Journal

of

Nature

Vol.

43

No.

1

REVIEW

ARTICLE

1

GPCR

激活机制研究中的方法与创新

GPCR

的激活是指激动剂结合引发的下游效

应蛋白的招募

GPCR

激活的本质是胞外侧激动

剂结合和胞内侧下游效应蛋白招募的互相耦合

别构通信的过程

即受体从非激活态到激活态

的构象转变

1

因此

研究

GPCR

激活机

P2

肾上腺素受体

视紫红质受体

A

2A

腺苷

受体

的激活过程或方式的理解日益深入

但对

家族层面的共同激活机制却知之甚少

究其原

一方面是结构被解析的受体数量仍然有限

另一方面是缺乏可精确描述构象变化的分析工

显然仅依靠肉眼观察或位移测量等传统方

法无法做到准确和系统地研究

以下重点阐述

GPCR

激活机制研究中的主要方法

1

与创

新点

激动剂

制不仅需要高精度的

GPCR

三维结构

而且需要

精确描述

GPCR

构象变化的分析工具

科学家经

过坚持不懈地努力

GPCR

特别是代表性受体

拮抗剂

受体激活

激活时的

CB1

(PDB

ID:

6KPG)

非激活时的

CB1

(PDB

ID:

5TGZ)

GP

1

大麻素受体

CB1

的构象变化

左侧为结合拮抗剂时处于非激活时的

CB1

结构

8]

右侧为结合激动剂和

G

蛋白时处于完全

激活态的

CB1

结构

9

1

GPCR

激活机制的研究方法

研究方法

X

射线晶体学

方法类型

结构生物学

结构生物学

单分子生物物理

单分子生物物理

范围

优势

劣势

单个

单个

单个

单个

单个

家族

家族

高精度的三维结构

快捷、近原子尺度

结晶困难

单颗粒冷冻电镜

核磁共振

BRET/

DEER

高分辨率结构偏少

无全局构象变化

无三维结构

精细局部构象变化

受体的动态特性

分子动力学模拟

计算化学

计算化学

计算化学

原子水平构象变化

快捷

模拟时间短于所需

过于简单

粗粒化

残基接触

残基接触打分

快捷

准确

需高分辨率结构

46

1.1

三维结构测定

由于

GPCR

的表达

纯化和结晶都存在极

大的困难

GPCR

的三维结构一直很难测定

随着

GPCR

昆虫表达系统的建立

融合蛋白和热

稳定性突变等的引入

高亲和力配体的筛选使

脂立方相

(

lipidic

cubic

phase,

LCP

)

膜蛋白

结晶技术的发展

10

GPCR

X

-射线晶体学研究

已取得巨大成功

其中代表性的成就有

2007

Brian

Kobilka

Raymond

Stevens

11

合作解析的

第一个人源

GPCR-P

2

肾上腺素受体

(

B

2

adrenergic

receptor,

B

2

AR

)

晶体结构

2011

Brian

Kobilka

12

解析的第一个

GPCR-G

蛋白异源三聚体晶体

结构和

2015

年徐华强等

13

解析的第一个

GPCR-P-

arrestin

复合物晶体结构

2017

年冷冻电镜技术被

应用到

GPCR

的结构解析中

14-15

使

GPCR

的三维

结构测定变得容易

值得欣喜的是

近年来多个

GPCR的结构首先被我国科学家解析

8,

13,

16-26

截至

2020

9月

GPCR

已有超过

80

个受体

400

余个结构被解析

其中

A

家族有近60

受体的

300多个结构被解析

这些结构揭示出

各受体在配体结合模式

耦合的G

蛋白亚型

激活方式等方面具有明显差异

依据配体分

子的药理学特性和受体的整体状态

这些结

构可分为

3

①拮抗剂或反向激动剂结合的

非激活态

(

inactive

state

)

:②同时结合激动

剂和下游效应蛋白(如

G

蛋白

P-arrestin

等)

的激活态(

active

state

)

③只结合激动剂的

中间态

(

intermediate

state

)□

A

家族有多个受

体处于非激活态和激活态时的结构都已被解

如牛视紫红质受体

(

bRho

)

P

2

肾上腺

素受体

(

P

2

AR

)

M2

毒蕈碱型乙酰胆碱受体

(

M2R

)

阿片受体

(

pOR

)

A

2A

腺苷受体

(

adenosine

A

2A

receptor,

A

2A

R

)和

阿片受体

(

k

-

0R

),

GPCR

家族层面的共同激活机制研究提

供了良好起点

1.2

核磁共振和分子动力学模拟

与三维结构测定的稳定的静态构象不同

核磁共振(

nuclear

magnetic

resonance,

NMR

)

4

垫亲点

43

卷第

1

专题综述

够在原子分辨率水平研究蛋白质的构象变化

补了晶体或电镜结构缺失的信息

为理解

GPCR

动态构象变化和激活机制提供全新的视角

NMR

GPCR

应用上的主要挑战是信号弱且杂

设计新颖有效的标记位点颇为耗时耗力

由于

GPCR

分子较大

NMR

只能使用

15

N

选择性标记

一两种出现频率不高且结构分布较广的残基

(

Gly

Trp)

27

,

或者使用含有

19

F

的分子来反应性

地标记事先选定的与激活关系紧密的一两个

Cys

位点

28-30

随着高场

NMR

改进的低温探针

稳定同位素标记及横向弛豫优化谱

(

transverse

relaxation-optimized

spectroscopy,

TROSY)

等技

术的应用

GPCR

NMR

研究取得突破性发展

如鉴定出

GPCR

存在着多种与功能密切相关的构

象状态

且受激动剂

拮抗剂

别构调节剂和下

游效应蛋白等调控

27-28

,

31

借助于不断优化的分子力场和计算机软硬

分子动力学模拟已被广泛应用于生物大分

子的结构和动态特性研究

GPCR

研究中正发

挥着日益重要的作用

32-33

分子动力学模拟使人

们得以了解药物分子如何进入结合口袋并激活受

跨膜信号如何转导

药物的偏向性信号通路

如何实现

胆固醇等脂质分子如何影响受体激活

等重要问题

也为

GPCR

的药物设计和激活机制

研究提供重要的研究工具

GPCR

嵌膜模拟体系

通常含原子数较多

模拟时间一般在微秒水平

无法覆盖

GPCR

的整个激活过程

且不同受体的

激活过程也会略有差异

因此通过分子动力学

模拟研究家族层面的

GPCR

激活机制仍有较大困

1.3

残基接触

GPCR

激活的本质是局部残基间相互作用的

改变诱发螺旋位置的变化

因此有必要开发计

算方法来描述残基间相互作用从非激活态到激

活态的转变

进而比较各受体在激活时的残基

作用改变的异同

最终建立家族层面的共同激活

机制

2016

年英国剑桥

MRC-MLB

Madan

Babu

课题组

使用残基接触(

residue

contact,

RC

)

47

Chinese

Journal

of

Nature

Vol.

43

No.

1

REVIEW

ARTICLE

研究

GPCR

的激活机制

残基接触的定义是

两残基有原子对间距离减去其范德华半径之和小

0.5

A

,

即认为两残基间存在接触

否则两残

基间没有接触

34

A

家族

GPCR

中同时有激活

和非激活态结构的

5

个受体

10

个结构进行残基接

触分析

研究人员发现有

6

组残基对在这

5

个受体

激活过程中具有一致的残基接触变化

即同时

消失或形成

其中

2

组残基对

(

3

X

46

7

X

53

5

X

55—

6

X

41

)

在激活后新形成接触

,余下

4

组残基对

(

1

X

53

7

X

53

,

3

X

46

6

X

37

7

X

53

8

X

50

7

X

54

8

X

51

)

则在激活后接

触消失

这里残基编号采用

GPCRdb

命名法

35

将每个

a

螺旋上序列最保守的残基定为

X

50

他残基依据与

X

50

在序列上的相对位置依次命

3

X

49

即为第

3

a

螺旋上

在序列上位于

最保守位点

3

X

50

的前一位

3

X

51

则为第

3

a

螺旋上

在序列上位于最保守位点

3

X

5

0

的后

一位

结合

A

家族其他结构的验证

他们发现靠

G

蛋白结合区域的两组残基对

(

3

X

46

6

X

37

3

X

46

7

X

53

)

具有家族普遍性

A

家族

GPCR

激活时都有这样的构象接触变化

因此

A

家族

GPCR

被认为具有多样化的激活通路

且这

些激活通路仅收敛于

G

蛋白结合区域

这一工作

GPCR

激活机制研究提供了全新的计算思路

但其揭示的共同激活机制却遗漏了一系列保守的

特征基序(

motif

,

序列中局部的保守区域)

CWxP

27,

36

PIF

37-38

DRY

39-40

钠离子结合

口袋等

27,

41

也无法解释

TM6

末端因何翘起

GPCR

的共同激活机制仍有待于完善

受到配体

-

残基相互作用定量描述的启发

42

我们提出残基接触打分(

residue-residue

contact

score,

RRCS

)

用以精确描述残基对间的接触强

43

将三维的

复杂的结构信息转化为二维

量化的残基接触打分

同时残基接触分差

(

ARRCS

=

RRCS

active

RRCS

inactive

)可精确描

述受体激活过程中的残基构象变化

残基接触

打分完全从蛋白质结构本身出发

不依赖于蛋

白质结构比对

(

alignment

)

且可将整体和局

显著和微小的构象变化系统地划分为开

关(

switching

)

和重排

(

repacking

)

螺旋间

48

(

inter-helical

)

和螺旋内

(

i

ntra-helical

)

等两个

层面的

4

种类型

为遴选出

A

家族

GPCR

激活时都

具有的保守的构象变化

我们首先分析

6

个受体

(

bRho

B

2

AR

M2R

pOR

A

2A

R

k

-OR

)

激活过程中的残基接触分差

一方面

检查这

些残基对在6

个受体中是否有统一的构象变化

即残基接触分差皆为正或负

另一方面

研究

这些残基对的接触打分

在家族层面的非激活

与激活态间是否存在显著性差异

(

142

个非激活

态结构和

27

个激活态结构)

我们最终发现在

A

家族

GPCR

激活时

34

组残基对具有保守的构

象变化

2

GPCR

的共同激活机制

2.1

A

家族

GPCR

的共同激活机制

基于家族保守的

激活时具有统一构象变

化的

34

组残基对

我们构建起

A

家族

GPCR

的共

同激活通路(图

2

)

34

组残基对由

35

个残

基构成

有机连接和整合了人们熟知的

序列

保守但空间疏离的特征基序

CWxP

27,

36

PIF

37

-

3

8

d

RY

39

-40

钠离子结合口袋等

27,

41

NPxxY

12,

34

在残基水平上回答

GPCR

如何被

激活

TM6

为什么会翘起

各基序如何协同作用

实现

GPCR

的跨膜信号转导

需要指出的是

一通路是

A

家族不同受体在不同激动剂或不同下

游效应蛋白时的共同部分

每个受体仍然具有独

特的

受体

/

配体

/

效应蛋白特殊的激活通路

依据这

35

个残基的空间位置和功能

我们

GPCR

的共同激活通路由胞外到胞内共划分

4

层(图

2

(

a

))

:①信号启动层

②疏水锁

③微型开关传递层

④胞内效应蛋白结合

激动剂的结合诱发配体结合口袋发生构象

变化

最终引起位于胞内口袋底部的特征基序

CWxP

PIF

发生结构重排

使得钠离子结合口

袋坍塌

最终实现信号启动

第二层疏水锁层

残基在接收到第一层的启动信号后

几个疏水

残基构成的疏水锁

(

6

X

41

3

X

43

6

X

40

3

X

43

)

被打开

分别通过

TM6

TM7

传递激

活信号

第三层由

2

个微型开关残基

(

6

X

37

7

X

53

)

控制

在接受到疏水锁层的信号后发生

4

垫亲点

43

卷第

1

专题综述

剧烈的构象变化

形成或破坏了一系列的残基

接触使得信号得以放大

第四层则将上述构象

段往外运动从而远离

TM3

这使得

TM7

可以往内

运动从而靠近

TM3

最终在受体的胞内侧形成

空隙以结合

G

蛋白等下游效应蛋白

值得注意的

变化通过结合胞内效应蛋白传递到胞内

最终

通过第二信使

cAMP

IP3

Ca

2+

等实现信号转

此前研究者在使用肉眼观察受体结构来判

断激活状态时

常过分关注

TM6

翘起与否

2

(

b

)

告诉我们非激活态最保守的特征其实是

TM3

TM7

之间的远离

而在激活态中

TM3

TM7

的残基之间具有广泛的接触

因此

我们

认为

TM7

的运动尽管不如

TM6

剧烈

同样是

综上

4

层残基互相配合

通过螺旋间

/

旋内的残基开关或重排实现

GPCR

的跨膜信号转

为表征跨膜螺旋的整体构象变化

我们选

TM3

TM6

间的所有

4

组残基对来计算

2

个螺

旋间的接触分

RRCS

tm

3-

tm

6

类似地还有

GPCR

激活所必需

从序列角度看

A

家族

GPCR

共同激活通路

上的

35

个残基具有较强的序列保守性

与之对应

RRCS

TM3-TM7

RRCS

T

M5-TM6

在将

142

个非激活态

结构和

27

个激活态结构投影到由

RRCS

TM3-TM6

RRCS

TM3-TM7

组成的二维空间时

我们发现

GPCR

的激活态和非激活态具有迥然不同的结构特征

(图

2(b

))

激活态的

RRCS

T

M3-TM6

为零

的是配体结合区域和

G

蛋白耦合区域的残基组成

RRCS

TM3-TM7

通常大于

5

;

非激活态的

RRCS

t

M3-TM7

通常接近或等于零

,而

RRCS

tm

3-TM6

分布广泛但

通常大于零

这充分说明

GPCR

激活时具有共同

的整体构象变化

即激动剂的结合触发

TM6

胞内

非常多样

我们认为

GPCR

共同激活通路中的

残基构成一个负责激活的模块

解放出配体结

合区域和

G

蛋白耦合区域来快速演化

这或许是

GPCR可以使用一个简单的折叠模式来实现如此

多样化功能的一个原因

2

A

家族GPCR

的共同激活机制

43

(

a

)

残基水平的共同激活通路

由在激活时具有保守构象变化的

34

组残基对构成;

(

b

)

激活时跨膜螺旋的构象变化

49

Chinese

Journal

of

Nature

Vol.

43

No.

1

REVIEW

ARTICLE

2.2

激活机制指导的组成性突变设计

GPCR

的激活需要共同激活通路上各残基的

参与

因此理论上可对这些关键残基进行干扰以

实现激活信号的关闭或开启

为此

我们对共同

激活通路上的残基进行理性突变设计以便将受体

锁定激活构象或非激活构象

这样受体将处于组

成性激活

不需要激动剂即可产生激活信号

失活

即使有激动剂也不产生激活信号

A

2A

腺苷受体是研究较多的

A

家族

GPCR

它耦合激

活型

G

蛋白

G

,

在结合激动剂后激活

cAMP

通路使得胞内

cAMP

含量增加

我们以

A

2A

腺苷

受体为例进行理性设计

最终证实

15

个设计的组

成性激活突变中的

6

20

个设计的失活突变中

15

个都被

cAMP

功能实验证实

且它们的配体

结合能力基本不受突变影响

这充分说明这些位

点在

GPCR

激活过程中扮演着重要角色

此外

我们还对耦合抑制型

G

蛋白

G

i

5

-羟色胺受

1B

5-HTe

和耦合激活型

G

蛋白的

5

-

羟色胺

受体

7

5-HT

7

进行基于

GPCR

共同激活通路的

突变设计

实验证实这些突变体具有类似的组成

性激活或失活效应

2.3

激活机制与致病突变

GPCR

的正常运作对于维持人体健康至关

重要

GPCR

的某些氨基酸突变可能会使

GPCR

功能紊乱并导致尿崩症

甲状腺功能亢进

腺功能减退症

糖皮质激素缺乏症等遗传学疾

[44]

为了研究

GPCR

信号转导与疾病的关联

我们从数据库和文献上共收集人类

GPCR

435

个疾病相关突变

发现其中有

25%

的突变发生在

GPCR

的共同激活通路上

这一比例显著高于配

体结合区域

20%

6

蛋白结合区域

7%

从突变发生率看

致病突变明显富集在共同激

活通路上

比配体结合区域高

2.5

G

蛋白

结合区域高

3.5

实际上

GPCR

的共同激活

通路也为我们理解致病突变机制提供思路

血管加压素

V2

受体

vasopressin

V2

receptor,

V2R

I130

3

x

43

N

突变会使得受体成为组成型

激活

导致肾原性抗利尿激素分泌失调综合征

N-SIAD

[45]

I13

0

3

X

43

F

则使受体失活

,产生

50

肾原性尿崩症

NDI

[46]

这可能是由于

I130N/

F

会削弱

/

增加疏水锁的稳定性

U

/

增强

TM3

TM6

间的作用

使受体的

TM6

更易

/

难翘起

导致受体处于激活

/

失活状态

再经过下游信号

通路的放大和转导

最终导致疾病的产生

3

展望

GPCR

激活机制是理解

GPCR

功能和理性药

物设计的钥匙

伴随着过去20

GPCR

结构解析

的巨大发展

以及单分子

单残基甚至单原子分

析技术的不断进步

我们对

GPCR

的认识日益深

对配体激活受体

受体耦合

G

蛋白等关键问

题也有了更丰富的认知

但距离全面理解

GPCR

的激活机制

家族共性和受体个性

仍有相当距

从药物研发角度看

如何设计药物以精细调

GPCR

的信号转导输出

如偏向性信号通路

亚型选择性

药物效率等重大问题

都绕不开

GPCR

的激活机制

总之

GPCR

的激活机制研

究内涵深刻

任重而道远

需要科研工作者们的

不懈努力

2020

10

1

日收稿

[1]

VENKATAKRISHNAN

A

J,

DEUPI

X,

LEBON

G,

et

al.

Molecular

signatures

of

G-protein-coupled

receptors

[J].

Nature,

2013,

494(7436):

185-194.

[2]

KATRITCH

V,

CHEREZOV

V,

STEVENS

R

C.

Structure-function

of

the

G

protein-coupled

receptor

superfamily

[J].

Annual

Review

of

Pharmacology

and

Toxicology,

2013,

53:

531-556.

[3]

HAUSER

A

S,

CHAVALI

S,

MASUHO

I,

et

al.

Pharmacogenomics

of

GPCR

drug

targets

[J].

Cell,

201

&

172(1/2):

41-54.

[4]

HAUSER

A

S,

ATTWOOD

M

M,

RASK-ANDERSEN

M,

et

al.

Trends

in

GPCR

drug

discovery:

new

agents,

targets

and

indications

[J].

Nat

Rev

Drug

Discov,

2017,

16

(12):

829-842.

[5]

LEFKOWITZ

R

J.

A

brief history

of

G-protein

coupled

receptors

(Nobel

Lecture)

[J].

Angew

Chem

Int

Ed

Engl,

2013,

52

(25),

6366

-

6378.

[6]

WEIS

W

I,

KOBILKA

B

K.

The

molecular

basis

of

G

protein-

coupled

receptor

activation

[J].

Annual

Review

of

Biochemistry,

2018,

87:

897-919.

[7]

THAL

D

M,

GLUKHOVA

A,

SEXTON

P

M,

et

al.

Structural

insights

into

G-protein-coupled

receptor

allostery

[J].

Nature,

2018,

559(7712):

45-53.

[8] HUA

T,

VEMURI

K,

PU

M,

et

al.

Crystal

structure

of

the

human

cannabinoid

receptor

CB1

[J].

Cell,

2016,

167

(3):

750-762.

[9]

HUA

T,

LI

X,

WU

L,

et

al.

Activation

and

signaling

mechanism

revealed

by

cannabinoid

receptor-Gi

complex

structures

[J].

Cell,

2020,

180(4):

655-665.

[10]

张浩楠

吴蓓丽

.

G

蛋白偶联受体的结构生物学研究

[J].

自然杂

2016,

38(3):

193-199.

[11]

ROSENBAUM

D

M,

CHEREZOV

V,

HANSON

M

A,

et

al.

GPCR

engineering

yields

high-resolution

structural

insights

into

p

-

adrenergic

receptor

function

[J].

Science,

2007,

318(5854):

1266

-

1273.

[12]

RASMUSSEN

S

G,

DEVREE

B

T,

ZOU

Y,

et

al.

Crystal

structure

of

the

p

2

adrenergic

receptor-Gs

protein

complex

[J].

Nature,

2011,

477(7366):

549-555.

[13]

KANG

Y,

ZHOU

X

E,

GAO

X,

et

al.

Crystal

structure

of

rhodopsin

bound

to

arrestin

by

femtosecond

X-ray

laser

[J].

Nature,

2015,

523(7562):

561-567.

[14]

ZHANG

Y,

SUN

B,

FENG

D,

et

al.

Cryo-EM

structure

of

the

activated

GLP-1

receptor

in

complex

with

a

G

protein

[J].

Nature,

2017,

546(7657):

248-253.

[15]

GARCIA-NAFRIA

J,

TATE

C

G.

Cryo-electron

microscopy:

moving

beyond

X-ray

crystal

structures

for

drug

receptors

and

drug

development

[J].

Annual

Review

of

Pharmacology

and

Toxicology,

2020,

60:

51-71.

[16]

ZHANG

H,

QIAO

A,

YANG

D,

et

al.

Structure

of

the

full-length

glucagon

class

B

G-protein-coupled

receptor

[J].

Nature,

2017,

546(7657):

259-264.

[17]

SONG

G,

YANG

D,

WANG

Y,

et

al.

Human

GLP-1

receptor

transmembrane

domain

structure

in

complex

with

allosteric

modulators

[J].

Nature,

2017,

546(7657):

312-315.

[18]

ZHAO

L

H,

MA

S,

SUTKEVICIUTE

I,

et

al.

Structure

and

dynamics

of

the

active

human

parathyroid

hormone

receptor-1

[J].

Science,

2019,

364(6436):

148-153.

[19]

HUA

T,

VEMURI

K,

NIKAS

S

P,

et

al.

Crystal

structures

of

agonist-bound

human

cannabinoid

receptor

CB1

[J].

Nature,

2017,

547(7664):

468-471.

[20]

MAO

C,

SHEN

C,

LI

C,

et

al.

Cryo-EM

structures

of

inactive

and

active

GABAB

receptor

[J].

Cell

Res,

2020,

30(7):

564-573.

[21]

YANG

F,

MAO

C,

GUO

L,

et

al.

Structural

basis

of

GPBAR

activation

and

bile

acid

recognition

[J].

Nature,

2020,

587:

499-504.

4]

垫亲点

43

卷第

1

专题综述

[22]

YANG

S

F,

WU

Y

R,

XU

T

H,

et

al.

Crystal

structure of

the

Frizzled

4

receptor

in

a

ligand-free

state

[J].

Nature,

2018,

560(7720):

666

­

670.

[23]

LIU

K,

WU

L,

YUAN

S,

et

al.

Structural

basis

of

CXC

chemokine

receptor

2

activation

and

signalling

[J].

Nature,

2020,

585(7823):

135-140.

[24]

YU

J,

GIMENEZ

L

E,

HERNANDEZ

C

C,

et

al.

Determination

of

the

melanocortin-4

receptor

structure

identifies

Ca(2+)

as

a

cofactor

for

ligand

binding

[J].

Science,

2020,

368(6489):

428-433.

[25]

LIN

X,

LI

M,

WANG

N,

et

al.

Structural

basis

of

ligand

recognition

and

self-activation

of

orphan

GPR52

[J].

Nature,

2020,

579(7797):

152-157.

[26]

PENG

Y

MCCORVY

J

D,

HARPSOE

K,

et

al.

5-HT2C

receptor

structures

reveal

the

structural

basis

of

GPCR

polypharmacology

[J].

Cell,

2018,

172(4):

719-730.

[27]

EDDY

M

T,

LEE

M

Y,

GAO

Z

G,

et

al.

Allosteric

coupling

of

drug

binding

and

intracellular

signaling

in

the

A2A

adenosine

receptor

[J].

Cell,

2018,

172(1/2):

68-80.

[28]

LIU

J

J,

HORST

R,

KATRITCH

V,

et

al.

Biased

signaling

pathways

in

p

2

-adrenergic

receptor

characterized

by

19

F-NMR

[J].

Science,

2012,

335(6072):

1106-1110.

[29]

SUSAC

L,

EDDY

M

T,

DIDENKO

T,

et

al.

A2A

adenosine

receptor

functional

states

characterized

by

(19)F-NMR

[J].

Proc

Natl

Acad

Sci

USA,

2018,

115(50):

12733-12738.

[30]

YE

L,

VAN

EPS

N,

ZIMMER

M,

et

al.

Activation

of

the

A2A

adenosine

G-protein-coupled

receptor by

conformational

selection

[J].

Nature,

2016,

533(7602):

265-268.

[31]

NYGAARD

R,

ZOU

Y,

DROR

R

O,

et

al.

The

dynamic

process

of

p

2

-adrenergic

receptor

activation

[J].

Cell,

2013,

152(3):

532-542.

[32]

LATORRACA

N

R,

VENKATAKRISHNAN

A

J,

DROR

R

O.

GPCR

dynamics:

structures

in

motion

[J].

Chem

Rev,

2017,

117(1):

139-155.

[33]

SUOMIVUORI

C

M,

LATORRACA

N

R,

WINGLER

L

M,

et

al.

Molecular

mechanism

of

biased

signaling

in

a

prototypical

G

protein-coupled

receptor

[J].

Science,

2020,

367(6480):

881-887.

[34]

VENKATAKRISHNAN

A

J,

DEUPI

X,

LEBON

G,

et

al.

Diverse

activation

pathways

in

class

A

GPCRs

converge

near

the

G-protein-

coupling

region

[J].

Nature,

2016,

536(7617):

484-487.

[35]

PANDY-SZEKERES

G,

MUNK

C,

TSONKOV

T

M,

et

al.

GPCRdb

in

2018:

adding

GPCR

structure

models

and

ligands

[J].

Nucleic

Acids

Res,

2018,

46:

440-446.

[36]

TRZASKOWSKI

B,

LATEK

D,

YUAN

S,

et

al.

Action

of

molecular

switches

in

GPCRs

—heoretical

and

experimental

studies

[J].

Curr

51

Chinese

Journal

of

Nature

Med

Chem,

2012,

19(8):

1090-1109.

Vol.

43

No.

1

REVIEW

ARTICLE

[42]

NGO

T,

ILATOVSKIY

A

V,

STEWART

A

G,

et

al.

Orphan

receptor

ligand discovery by

pickpocketing

pharmacological

neighbors

[J].

Nat

Chem

Biol,

2017,

13(2):

235-242.

[37]

ISHCHENKO

A,

WACKER

D,

KAPOOR

M,

et

al.

Structural

insights

into

the

extracellular

recognition

of

the

human

serotonin

2B

receptor

by

an

antibody

[J].

Proc

Natl

Acad

Sci

USA,

2017,

[43]

ZHOU

Q,

YANG

D,

WU

M,

et

al.

Common

activation

mechanism

of

class

A

GPCRs

[J].

eLife,

2019,

8:

50279.

[44]

THOMPSON

M

D,

HENDY

G

N,

PERCY

M

E,

et

al.

G

protein-

114(31):

8223-8228.

[38]

SCHONEGGE

A

M,

GALLION

J,

PICARD

L

P,

et

al.

Evolutionary

action

and

structural

basis

of

the

allosteric

switch

controlling

p

2

AR

functional

selectivity

[J].

Nat

Commun,

2017,

8(1):

2169.

coupled

receptor

mutations

and

human

genetic

disease

[J].

Methods

Mol

Biol,

2014,

1175:

153-187.

[45]

ERDELYI

L

S,

MANN

W

A,

MORRIS-ROSENDAHL

D

J,

et

al.

[39]

ALHADEFF

R,

VOROBYOV

I,

YOON

H

W,

et

al.

Exploring

the

free-energy

landscape

of

GPCR

activation

[J].

Proc

Natl

Acad

Sci

Mutation

in

the

V2

vasopressin

receptor

gene,

AVPR2,

causes

USA,

2018,

115(41):

10327-10332.

nephrogenic

syndrome

of

inappropriate

diuresis

[J].

Kidney

Int,

2015,

88(5):

1070-1078.

[46]

PASEL

K,

SCHULZ

A,

TIMMERMANN

K,

et

al.

Functional

[40]

ROTH

B

L,

IRWIN

J

J,

SHOICHET

B

K.

Discovery

of

new

GPCR

ligands

to

illuminate

new

biology

[J].

Nat

Chem

Biol,

2017,

13(11):

1143-1151.

characterization

of

the

molecular

defects

causing

nephrogenic

diabetes

insipidus

in

eight

families

[J].

J

Clin

Endocrinol

Metab,

2000,

85(4):

1703-1710.

[41]

KATRITCH

V,

FENALTI

G,

ABOLA

E

E,

et

al.

Allosteric

sodium

in

class

A

GPCR

signaling

[J].

Trends

Biochem

Sci,

2014,

39(5):

233-244.

Common

activation

mechanism

of

GPCR

ZHOU

Qingtong

,

DAI

Zhizhuo

②③

,

ZHAO

Suwen

②③

School

of

Basic

Medical

Sciences,

Fudan

University,

Shanghai

200032,

China;②

iHuman

Institute,

ShanghaiTech

University,

Shanghai

201210,

China;

School

of

Life

Science

and

Technology,

ShanghaiTech

University,

Shanghai

201210,

China

Abstract

G

protein-coupled

receptor

(GPCR)

family

is

the

largest

and

most

diverse

group

of

membrane

receptors

in

eukaryotes.

By

mediating

a

wide

variety

of

physiological

functions,

GPCRs

are

important

drug

targets

with

around

500

marketed

drugs.

The

breakthrough

of

GPCR

structural

studies

leads

to

the

determinations

of

over

400

structures,

which

highlights

the

diversified

ligand­

binding

modes

and

signal

transduction

mechanisms

across

GPCRs.

In

recent

years,

a

common

activation

mechanism

of

class

A

GPCRs

has

been

discovered,

by

using

residue-residue

contact

score

(RRCS)

that

can

quantitatively

describes

the

rearrangements

of

residue

contacts

upon

receptor

activation.

Here,

we

briefly

summarize

the

approaches

utilized

in

GPCR

activation

mechanism,

and

also

discuss

the

significance

of

understanding

GPCR

activation

mechanism

on

functional

studies

and

drug

discovery.

Key

words

G

protein-coupled

receptor,

activation

mechanism,

allostery,

drug

discovery

编辑

温文

自然信息

把数据存在活细菌里

Hello

World

是许多程序员

物化学

成本更低的那一天

但实际上

DNA

存储数据并不是个新点子

对数据存储而言

DNA

在许多

方面都很有吸引力。

比如

相较于目

美国的

科学

Science

报道

究人员通常将二进制语言

0

1

转换为

DNA的

4个碱基

AGCT

腺嘌吟、

的第一行代码

但你见过从生物活体

内读岀的

Hello

World

哥伦比

前结构最紧凑的硬盘

DNA

的密度是

前者的

1

000

倍以上

一粒盐大小的面

积上能存储

10

部完整的数字电影

亚大学的一个研究小组做到了

他们

把数据写入活细菌的

DNA

。相关研

嘌吟

胞嘧啶

胸腺嘧啶

再用合

成器将代码写入

DNA

下转第

60

随着时间推移

读取和写入

2021年

1

11

日发表于

自然一生

DNA

的技术终将迎来实用性更强

52