基于网络药理学与分子对接探讨紫草治疗银屑病的作用机制

系统教程410 更新时间：2025-09-07 05:03:30

2024年3月29日发(作者：)

・

655

•

世界中西医结合杂志

2021

年第

3

卷第

4

期

World

Journal

of

UtegmUd

Tmditionai

and

Westeo

MeXicioc

2021

,

Vol.

3

,No.

4

-药物研究

•

基于网络药理学与分子对接探讨紫草治疗

银屑病的作用机制

王宁丽李建伟王刚

【摘要

】

目的

运用网络药理学与分子对接探索紫草治疗银屑病的作用机制

。

方法

通过

TCMSP

、

Pub-

Chem

及

Swiss

Taryc

Prediction

数据库和

Gene

Cards

、

OMIM

数据库筛选紫草活性成分

、

疾病靶点

，

运用

Cytoscape

软

件构建药物与疾病间相互作用网络

，

筛选紫草治疗银屑病的活性成分及靶点;基于

R

软件进行

GO

功能注释和

KEGG

通路富集分析;将活性成分与核心靶点进行分子对接验证

。

结果

预测得到

17

个紫草治疗银屑病的活性

成分和

55

个差异基因,并推断其作用机制可能与乙型肝炎

、

糖尿病并发症

、

胰腺癌

、

PI3K-Akt

信号通路

、

MAPK

信号通路

、

Rayl

信号通路

、

IB

-

17

信号通路等有关

。

其中

TNF

、

EGFR

、

MMP3

、

PTGS2

等基因可能为关键靶点;分子

对接结果显示:去氧紫草素与

PTGS0

蛋白的亲和力较好

。

结论

紫草治疗银屑病具有多成分

-

多靶点

-

多通路

的作用特点

，

为阐述紫草治疗银屑病的作用机制和开展进一步的研究提供依据

。

【

关键词

】

紫草;银屑病

；

网络药理学;靶点;分子对接

【

中图分类号

】

R35.5

；

R758.63

【

文献标识码

】

A

Mechanism

Sthdy

of

Lithospermum

Erythrorhizon

in

the

Treatment

of

Psoriasis

Basee

on

Network

Pharmacdogy

WANG

Ning

-P,L)

pan

-weRWANG

Gang

(

The

First

AffiliaUd

Hospiml

of

Henau

University

of

TmbitUnal

Chinese

Medicine

,

Zhenazhox

Henau

454000)

[

Abstract

i

Objective

Netword

pharmacodgp

and

modchlar

doching

were

used

to

preXic-

the

mechanism

of

Lithospermum

ErythrorUizon

in

the

treatment

of

pso/asis.

Methodt

Based

on

TCMSP,PuUChem,SwissTamePpdictUn

Ua-

ubase

and

GeneCards

and

OMIM

daubase

to

screen

out

active

ingredients

and

corresponding

Uryets

of

Lithospermum

ErythrorUizon

bp

using

Cytoscape

software

to

consWuct the

interactive

netword

among

medicine

and

disease

to

screen

out

the

poUnUal

ingredients

and

Uryets

of

Lithospermum

ErythrorUizon

in

the

Weatuent

of

pso/asis.

In

abdiUon

,

the

information

of

signaling

pathway

was

obuined

after

the

GO

en/chment

analysis

and

KEGG

path

wap

analysis

were

peVormeX

based

on

R

softwares

,

and

then

the

mechanism

of

action

was

expdpX.

Finally

,

modchlar

doching

vevficakon

of

active

ingredients

and

key

Uryets

was

conducuX.

Reshlts

)t

is

preXicuX

that

17

active

ingredients

of

comfrey

for

the

Weatuent

of

pso/asis

and

55

diRerenUal

genes

are

obtained

,

and

its

mechanism

of

action

map

be

inferred

to

be

heyakUs

B,diabetic

compli

cations

,

pancreako

cancer,

PI3K

-

Akt

signaling

pathway

,

MAPK

signaling

path

wap

,

Ray

7

Signal

pamwap,IL17

signal

path-

wap,eU.

are

related.

Among

them,TNF,EGFR,MMP3

,PTGS2

and

other

genes

map

be

key

taryets

；

modchlar

doching

re

sults

show

that

desoxyshibonin

has

a

good

—

Uky

with

P0GS0

proUin.

Conclusion

Based

on

netword

pharmacology

,

it

is

dischssed

that

comfrey

has

-he

chamcte/stics

of

multi

-

component

-

multi

-

taryc-

-

multi

-

path

wap

in

the

treatment

of

pso/asis,which

proviUcs

a

basis

for

ePcidatUg

the mechanism

of

comfrey

in

the

treatment

of

psoriasis

and

conductUg

fur

ther

research.

[

Keewords

t

Lithospermum

ErythrorUizon

；

Psoriasis

;

Network

Harmacodgy

；

Taryet

；

Modchlar

Doching

银屑病在临床中又被称之为牛皮癣

，是一种极

认为银屑病属于

“

白

秓

”

范畴

，

主要由机体血热内

为常见且顽固的慢性复发性炎症性皮肤病

。

当前,

虽然已有较多治疗方法

,

但效果一般

，

较难治愈

，

因

蕴

、

营血亏虚以及肌肤失养导致

。

从中医辨证角度

出发

，

应以

“

从血论治

、

凉血解毒

、

清热泻火

”

治疗本

而对患者日常生活

、

工作造成了严重影响

。中医学

病

。

但由于银屑病发病原因极为复杂

，

目前仍没有

特异性药物用以治疗

，

西医治疗主要以激素类药物

DO)

：

12.

53935/j.

akk

”

zp

.

410414

和免疫调节类药物为主

，

但具有临床疗效不理想,

基金项目

：

国家重点研发计划

“

中医药现代化研究

”

重点专项课题

(319YFC1775309

)

；

国家自然科学基金委员会-

NSFC

项目

(U1454823

)

作者单位:河南中医药大学第一附属医院

/

可南郑州

4560091

通信作者:王宁丽

,

Email:mamazPoxg2129@

33.

com

且能引发严重不良反应的弊端

［

］

。

然而

，

中医药作

为我国的传统医学，

治疗具有作用靶点多

、

药物不

良反应小等特点

，

其中在慢性疾病治疗中具有较好

世界中西医结合杂志

2021

年第

4

卷第

4

期

World

Journd

of

Integrated

Trapi/onai

and

Western

Me/icide

2021

,Voi.

12

,

No.

4

・

556

•

的临床疗效

。

因此

，

寻求中医中药治疗银屑病的新

策略

，

是其在改善患者病发症状

、

减轻痛苦

、

提高生

通过人类基因组注释数据库

(

Gexecards

U1-

tps

：

/

/www.

gexecards.

org/)

和人类孟德尔遗传数据

库(

OMIM,https

I

Lefww.

omin.

org/

)

，

获得与银屑病

活质量方面发挥着越来越大的作用

4

—

5

］

o

紫草为紫草科多年生草本植物紫草

Lithosper-

疾病相关的已知靶点信息

。

mum

e

—

throrhizon

Str.

El

Zuce.

或新疆紫草

Ambia

euchroma(

Royiv)

JodnsW

或内

蒙紫草

Ambia

guttath

49

构建紫草活性成分-靶点网络

通过上述方法可获取紫草的活性成分及作用

靶点

。

由于活性成分与靶点具有对应关系

，

所以使

Bu/x

的根

。其味甘、

性寒

，

归心

、

肝经

，

具有凉血活

血

、

解毒透疹等功效⑷。

然而

，

众多医者在治疗银

屑病时始终将紫草作为主要的药材融入组方配伍

用Cytoscaga

3.

7.

2

软件进行可视化分析

。

其中节

点

(Node)

大小和颜色设置用于反映度值

(Deyrev

)

中

，

发挥紫草清热解毒凉血的功效

。

在治疗寻常型

银屑病不同证型以及红皮型银屑病时均以紫草为

主贯穿整个治疗周期

［

］

。

中药作为我国传统中药

，

一直具有多成分

、

多靶点的作用特点

。

实验研究证

实

,紫草中多种化学成分在治疗银屑病方面发挥显

著的作用

。

其中

，

紫草素可以通过抑制

Caspase

-1

的活化

，

抑制分离的

Caspase

-

1

的活性进而达到抗

炎的作用

。

此外

，紫草的抗菌作用也能够抑制抗生

素的耐药性及对真菌性疾病的治疗起到积极作

用

［

一

4

］

。

本研究基于传统中药的独有优势与银屑病

所面临的临床瓶颈

，

通过借助网络药理学的研究方

法,对紫草潜在化合物进行筛选

，

对中药的多成分

-

多靶点

-

多通路的作用特点进行研究

［

］

。

通过

建立疾病-蛋白

-

药物的多层次网络结构

，

整体全

面地观察紫草对银屑病的治疗与影响

，

进而探究紫

草治疗银屑病的作用机制

，

并为治疗银屑病及其他

疑难皮肤病的中药新药制剂的开发与利用提供参

考与思路

4

］

o

1

材料与方法

91

紫草活性成分的筛选

通过检索

TCMSP(htty

：

/

/lsp.

nwu.

edu.

cd/Wm-

sysearch.

9hp)

数据库

，

收集中药紫草的主要化学成

分

。

考虑中药成分复杂，

并非所有成分均被吸收,

结合文献及平台推荐

，

设置条件参数口服生物利用

度

(OB)32%,

类药性

(DL)0.18

,

初步筛选出中药潜

在的活性成分

。

1

.

9

预测活性成分所对应的靶基因

通过

TCMSP

、

PubChem

、

Swiss

Taryet

Prediction

数据库逐一对比得到紫草潜在化合物对应的作用

靶点

。

然后

，

利用蛋白质数据库

(Unipod)

(https：

/

www.

uni/roW

3rg/)

获得与潜在活性成分相关的靶点

蛋白信息

，

对潜在靶点进行标准化

，

筛选来自人类

属性的靶点基因

。

1.5

银屑病的疾病靶点

的大小,

最终绘制活性成分-靶点网络图

。

47

药物与疾病共同靶点筛选及蛋白互作网络

(PPI

)

构建

通过

Interactive/d

网站对药物靶点和疾病靶点

取交集

，

命名为"药物-疾病

-

靶点

(Drug

-

disease

target

)

”

。

将获得的交集靶点导入

StWnp

数据库进

行蛋白

-

蛋白互作用(

Protein

protein

interaction

,

PPI

)

分析

，

物种选择

"Home

sagiexs

”，

参数

Uterae-

Won

score

设定为

0.

400

。

保存获得的结果

，

导入

Cymscage

3.7.0

软件对其网络进行分析

。

将节点大

小和颜色用于反映度值的大小

，

边的粗细用于反映

结合分数

(

Combidg

score)

的大小

，

进而获得蛋白互

作可视化网络并明确关键靶点

。

49

构建药物-成分-作用靶点-疾病作用网络图

使用

Cymscage

3.7.0

软件

，

将紫草中药治疗银

屑病的药物

、

成分

、

靶点

、

疾病之间的相互作用关系

构建可视化网络图

。

网络图中

“

节点

”

代表药物

、

活

性成分

、

靶点与疾病

，

“

边

”

代表各个节点之间的

联系

。

4

7

京都基因与基因组百科全书

(

KEGG

)

通路富

集分析与基因功能分析

(GO

)

使用

Pert

语言结合

Unipod

数据库将交集靶点

名称全部转换为

Entrer

Ge/v

ID,

以供后续操作;使

用

R

语言的安装包

，

下载

R

语言的

Bioconducer

生

物类程序包

。

输入转换好的交集靶点

Entrer

Ge/e

ID,

并运行

R

语言脚本进行

GO

功能分析和

KEGG

通路富集分析

。

48

分子对接

采用

AutoDoch

vina

软件对

PPI

网络中核心靶

点蛋白与紫草的活性成分进行分子对接

，

评估活性

成分与关键靶点之间的结合活性

。

从

RCSB

PDB

蛋

白质结构数据库和

PuPChem

数据库中分别获得靶

点蛋白的三维结构和化学结构

，

采用

AutoDoch

Tools

软件对上述蛋白受体和配体进行常规处理

，

再利用

插件

AuWgnd

得到对接活性位点

,

进行分子对接

,

得

・

660

•

世界中西医结合杂志

2601

年第

6

卷第

4

期

World

Jouroat

of

Integrated

Traditiopat

and

Western

Medicioe

2601,

VoL

6

,No.

4

到结合能(affinity

)0

查阅文献

[6],

本研究以结合

外

，

通过

TCMSP

及

Swiss

Tarye

PwdictWp数据库共

能

-5.0

1/1

x

1

为分子与靶点结合性较好

。

2

结

果

获得作用靶点

372

个

。

2.2

紫草活性成分-靶点网络构建

将药物活性成分与作用靶点导入

Cymsca/e

2.

1

活性化合物的筛选及作用靶点获得

本研究根据

OBM3

2%

,DL

M

2.

13

的原则

，

运用

TCMSP

数据库检索到紫草中药活性化合物

6

个

。

结果见表

6

文献检索到紫草活性成分

4

个

。

此

Mol

)U

MOLO21/9/

MOLO22372

MOLO22883

3.5.0

软件中

，

绘制

“

活性成分

-

靶点

”

图

。

由于

MOL022372

、

MOL027735

化合物在数据处理过程中

未查及相关作用靶点

，

故将其剔除

。

该网络共包括

400

个节点

,973

条边

。

结果见图

1

。

OB

42.20

表

1

TCMSP

数据库中紫草活性化合物的基本信息

MolName

Mankeoat

(5Z,10E,

14E

,13E)

-7

j^lO

,17,17,23

—

hexamethy/etwcou

-7,312,1/,13

,27

—

hexaenc

EtUyl

oleate

(

NF

)

sitosterol

DL

2.17

0.92

2.17

0.77

0.26

0.27

33.55

37.9

MOLOO2375

MOLO2771/

MOLO27717

MOLO27742

35.71

73.29

1

—

metPoxyacetylshidonin

[(1

R)

-

1

-

(5,3

-

nhynroxy

-1,4

—

Oioxo

-

7

—

naphthyl

)

-/

—

metPyl

-

pent

-3

—

eoyt]

propanoato

acetyNhidonin

Uoarnedin

/

Nhosperminin

A

50.9/

52.37

50.

77

75.28

0.20

2.38

0.2/

MOLO27748

M0L02773/

5

-

[

E

)

—

5

—

((

—

fuwV

—

7

—

metPyl

—

pent

-7

—

eoyt]

-7,3

—

Oimethoxy

-

p

—

benzoquinone

563

MOLO27737

Dex

-

O

—

metPyllasioUiploUin

Lithosperminin

B

32.12

60.45

0.20

2.37

V1MP3

KLT3

^

FGR

AXL

HDAC7

MAP3MCYPIBl

PSEXI

CDC25B

STK24

SRC

MMPH

PIK3CD

PIK3CG

PI4KB

CA9

MTOR

LOX5A1

ESRI

SYK

IISP90AA

IDOi

EGLX1

WEE2

GUSB

DYRKIA

GRM5

PLKL

CXCR2DC25A

ABCG2

SBK3

BMP1

PIK3C/V

CCNEI

DUT

D

RK2RPS6KA3

GCGR

TLKI

MAP3K10EEF2K

CIIRNz7!ICRTRl

ST/VT3

PL

JP90ABI

TERT

CDK5

FZR

CM

Al

l>APK3

DMT3BEI..WE

KCNII2

SLC2/M

IXSRR

CCNE2

VI

SPIIKI

PAK3

DORAI

CCNB2

CPTIA

PKI0

STK26

CSF1R

INSR

BIK

CSNK2AI

AKTI

MSTIR

FAP

IIDAC2

•|>PKI

AURKCIM)KA2

.PL

NTRKI

ECEI

MMP1

IIDACI

TBKI

CTSS

5

MARI

KAXiSI

SO

ATI

DAMTSf

MMP2

MIF

BM

HSDIlBi

PPARC

；

IMPDHI

PTK2B

F

PSE

a

LP3K8CCNBI

/XTP4B

MEI

KCNJI

CEIJKI

FKBPIA

I1MI7C<

XDI

BRA

I

LRX

I

DAPK2

KPI1X2

l)Nn

IJMK2

NR3C

CCR3

C/SP7

TIIRy

RORC

P1IB2PSEM

R3

CDKL

:

DMI/

PDE4D

GRM

3C2X

CXCR4

CLK2

ASP

I

KPP2

EPIIA2

CDK7

IIIPK1

GCK

YES

I

CFD

TEC

M/XP2KI

n

TXK2

EPIIB2

A.

Bl

1

ADOR.

PREP

TYK2

TMK

CA2

PDK4B

SPIIK

：

CDKI

PARPI

PDK!

SI.C29/1

□RA2I

LY

NCO/K2

CDKI

CI.K3

KIEII

TTK

CES2

BIRC2

J

AKA

)

R2

PDEI0A

G/K

IAP3K1IK3C2BPIK3RI

IIDAC-

CASP3

PPI

PAK4

PAK2

IOPI

(

；

SK3B

BA(

KI

RIOK2

E(

；

FR

C

I)AM33

PI>E5A

NQO2

ANPEP

TYMS

Bl

( DK4

CCNB1

PDG

[

；

FRA

XEK7

<

I)K5R1

PIK3CDCSNKM2

H1PK3

FLT4

IIIPK2

I)RA2(

ESR2

BMPR2

RCKKI

DAPKI

FGFRI

NTRK

：

ATP4A

TRAPI

RIIKI

l

P

(

.

(

OM

I

l

IUK4

1

'CCR4

I

PIIBI

FCER2

IKBKE

JAK1

IIDAC6

MYLK

T/CR1

IISDI7B1

D/O

(

.B

(

III

K

K.l

R2

(

Rl

CDK2

RPS6K/

TSPOPK6

XSI

I

P5R

l

RkB

PIII

SIKI

PC.R

SOI2

lls|)|-|13PI

2(.7

M

P3k7

R4I

MMPIO

MME

C/XI4

注:蓝色节点代表紫草中药

,

紫色节点分别表示中药的化合物

，

红色节点表示作用靶点

图

1

紫草活性成分-靶点网络图

世界中西医结合杂志

2021

年第

4

卷第

4

期

World

Journd

of

Integrated

Trapi/onai

and

Western

Me/icide

2021

.Vol.

12

.No.

4

・

5

91

•

2.8

紫草治疗银屑病的重叠靶点获取

通过

Ge/v

Cards

和

0MIM

数据库共获得银屑病

疾病靶点

;

通过对活性成分靶点进行无对应靶点蛋

白的筛选及删除重复靶点

，

最终获得

801

个疾病作

用靶点

。

经过

Interactive//

网站分析得到药物与疾

病的共同靶点

55

个

，

即紫草治疗银屑病的预测作用

靶点

。

结果见图

2

。

2.0

重叠靶点蛋白互作网络

(PPI

)构建

将

String

数据库得到的蛋白互作结果导入

Cy-

mscapa

3.

9.

2

软件进行可视化

，

结果见图

3

。

该图

节点表示蛋白

，

边表示蛋白

-

蛋白相互关系

。

删除

PPI

网络中的独立蛋白

，

共涉及

53

个节点

，

355

条

边

，

其中网络参数见表

2

o

颜色由浅到深表示节点

的度

(

Degree)

逐渐升高

，

连线由细到粗表示结合分

数

(Combine

score)

逐渐增大

。

经过筛选得到重要基

因

TNF

、

EGFR

、

MMP2

、

PTGS2

等

。

其中

TNF(deyree

-

91

)

,

EGFR

(

deyrev

-

32

)

,

MMP2

(

deyrev

-

32

)

在

网络中具有较高的度

，

表明在网络中处于重要的作

用

，

结果见图

9

o

MX1P1

PPARG

XUPKI/

•

CCNDI

USP90AAI

J

MX1PI2

FGFR2

MAPK8

'

STAT3

SLC2AI

TGKBRI

图

3

重叠靶点

PPI

网络图

4

前

30

个关键蛋白条形图

图

4

前

30

个关键蛋白条形图

表

2

PPI

蛋白互作网络参数

网络参数

数值

节点数

(

Number

of

kodes

)

55

网络密度

(

Netword

(/

”

—

)

6.253

网络直径

(

Netwud

diameter-

3

网络异质性

(

Netwod

UeWmeegeim

)

07741

平均相邻节点

(

Average

dumber

of

veighbou

-

137396

特征路径长度

(CharacWriRie

path

le/gth

)

9

968

最短路径(

Shute

”

paths

-

0759(49%

)

网络中心势

(

Netword

cextralizatiop

)

9.550

2.9

“

药物

-

活性成分-疾病

-

靶点

”

网络的构建

与分析

将上述获取的信息进行整合

，

利用

Cytoscage

3.

9.

6

软件绘制

“

中药-活性成分

-

疾病

-

靶点

”

网

络

，结果见图

5

o

通过网络图可知，

中药具有多种活

性成分

，

不同活性成分可以对应多重靶点

，

从而整

体构建一个复杂成分的分子网络

，

这也表明紫草中

药治疗银屑病可以发挥多成分

、

多靶点

、

多途径的

作用特点

。

2.9

基因功能与通路富集分析

利用

Pert

语言将重叠的

55

个基因名称转换为

Entrer

Ge/v

ID,使用

R

包的

Bioconducter

运算并导

出

GO

功能富集分析

(P<9.95

),

其中生物学进程

(BP

)

主要涉及平滑肌细胞增殖

、

肽基酪氨酸修饰

、

胶原分解代谢过程等方面;细胞组成

(CC

)

主要涉及

膜微区

、

囊泡腔

、

胶原蛋白细胞外基质等方面;分子

功能

(MF

)

主要涉及金属内肽酶活性

、

跨膜受体蛋

白酪氨酸酶活性

、

生长因子结合以及细胞因子受体

结合合等方面

。

将基因

GO

本体条目按

P

值进行排

序

，

分别选取

BP

、

CC

和

MF

的前

19

绘制如图

，

结果

见图

9

o

KEGG

通路富集筛选见图

7

o

主要涉及疾

病通路

、

炎症相关通路等

。

疾病通路主要包括疱疹

・

6

62

•

世界中西医结合杂志

2027

年第

3

卷第

4

期

World

Journal

of

UtegmUd

Tmditionai

and

Westeo

Me/icidc

2027

,

Vol.

3

,Nv.

4

M

旷.〒

X

psoriasis

jrylshikonin

MYLK

PDE4A

Isobutyrylshiko

ni

PDGFRB

PIK3CG

D.

iin

砾

H

闕

PTGS1

SLC2A1

»apl?tH^Qr4-niethyi-peht-3-enylJ

P-P-dim

(

STAT3

TACR1

W

/

TGFBR1

I

TLF>

V/

TNF

I

斟

5

"

<0

注:图中蓝色节点代表药物

，

青绿色节点表示活性成分

，

红色节点代表疾病

，

绿色节点形表示靶点

，

边代表中药-活性成分

、

活性成分-靶

点、

靶点-疾病之间的关系

。

图

5

紫草一活性成分一银屑病一靶点网络

extracellular

matrix

disassembly

muscle

cell

proliferation

peptidyl-tyrosine

phosphorylation

peptidyl-tyrosine

modification

positive

regulation

of

protein

serine/threonine

kinase

activity

regulation

of

smooth

muscle

cell

proliferation

smooth

muscle

cell

proliferation

extracellular

matrix

organization

extracellular

structure

organization

collagen

catabolic

process

membrane

raft

membrane

microdomain

membrane

region

collagen-containing

extracellular

matrix

apical

part

of

cell

focal

adhesion

cell-substrate

junction

apical

plasma

membrane

vesicle

lumen

ficolin-1-rich

granule

图

6

紫草

GO

富集分析

世界中西医结合杂志

2027

年第

3

卷第

4

期

World

Journ

—

of

Integrated

Traditional

and

Western

Me/icidc

2027

,

Vol.

16

,

No.

4

・

6

69

•

PI3K-Akt

signaling

pathway

-

MAPK

signaling

pathway

-

Kaposi

sarcoma-associated

herpesvirus

infection

-

IL-17

signaling

pathway

-

Hepatitis

B

-

Rap1

signaling

pathway

-

Ras

signaling

pathway

-

AGE-RAGE

signaling

pathway

in

diabetic

complications-

Th17

cell

differentiation

-

Taxoplasmosis

-

Osteoclast

differentiation

-

Relaxin

signaling

pathway

-

Necroptosis

-

Focal

adhesion

-

Proteoglycans

in

cancer

-

Human

cytomegalovirus

infection

-

EGFR

tyrosine

kinase

inhibitor

resistance-

PD-L1

expression

and

PD-1

checkpoint

pathway

in

cancer

-

Prostate

cancer

-

Fluid

shear

stress

and

atherosclerosis

-

JAK-S7AT

signaling

pathway

-

NOD-like

receptor

signaling

pathway

-

Pancreatic

cancer

-

Endocrine

resistance

-

TNF

signaling

pathway

-

Bladder

cancer

-

Adipocytokine

signaling

pathway

-

Prolactin

signaling

pathway

-

Epithelial

cell

signaling

in

Helicobacter

pylori

infection

-

Leishmaniasis-

0.10

Count

•

5

•

9

•

”

•

13

I

0.15

0.20

GeneRatio

2e-04

4e-04

6e-04

0.25

图

7

紫草

KEGG

富集分析

表

3

活性成分的分子对接结果

Nam?

Mandeyol

Taryet

PDBED

AffUitp

l

J/nP

)

Nam?

PmpUxyPUiboxib

Taryet

PDBED

AffUitp

l

J/nP

)

-6.1

EGFR

5WB7

5FIS

-4

4

-

6

5

5WB7

PTGS0

STA07

PTGS0

STA07

5FIS

1GB1B

5WB7

-7.0

-3.1

1GB1B

-1

2

-

62

-

6

2

5WB7

EGFR

-7.5

-8.2

-3.0

-5.0

-7.0

1

-

netUoxyacetylsUidouin

PTGS0

STA07

5FIS

0

-

0

'

-

diuetUydcmPyPPanin

PTGS0

STA07

5FIS

1GB1B

5WB7

1GB1B

-3

1

-

62

J

(

1R

)

一

、

一

(

5,8

-

didypmxp

-1,4

-

dioxx

-

0

-

naphthyl)

-

4

-

methyl

-peyt

-3

-

e/yp

pmpadoate

EGFR

5WB7

5FIS

EGFR

TovaPmlsPidouin

PTGS0

STA07

-8

4

-3

2

-

6

2

PTGS0

STA07

5FIS

1GB1B

5WB7

1GB1B

-3.5

-6.4EGFR

acetyPPiboxib

5WB7

5FIS

EGFR

TobutymPPidouin

PTGS0

STA07

-8

5

-3

1

-

6

4

PTGS0

STA07

5FIS

1GB1B

5WB7

-7.3

-0.2

-5.0

-8.1

1GB1B

EGFR

Toarke/ib

4

5WB7

5FIS

EGFR

PTGS0

STA07

-9

2

-0

2

-

6

2

0

-

hyPmxyisovadmPUiboxib

PTGS0

STA07

5FIS

1GB1B

5WB7

1GB1B

-0.3

-5.0

-7.0

-0.2

-

EGFR

5WB7

5FIS

EGFR

a

-

nethyPutymPPidouin

PUppevnibm

A

PTGS0

STA07

-7

2

-3

2

-

6

2

PTGS0

STA07

5FIS

1GB1B

5WB7

1GB1B

6

-

J

[

E

)

-6-(3-

furyl

-

0

-

methyl

-

peyt

-0

-

e/yp

-0,3

-

dl-

nethoxy

-

p

-

beyzoquidode

EGFR

5WB7

5FIS

EGFR

PTGS0

STA07

-7

2

-0

2

-

6

2

0

-

hyProxyisovaPpPPanin

PTGS0

STA07

5FIS

1GB1B

5WB7

1GB1B

EGFR

5WB7

5FIS

EGFR

AcetyPkanin

LtUppevnibm

B

PTGS0

STA07

-8

2

-3

2

-

62

PTGS0

STA07

5FIS

1GB1B1GB1B

EGFR

5WB7

5FIS

DeoxysUidouin

PTGS0

STA07

-9

4

-3

4

1GB1B

病毒感染

、

乙型肝炎

、糖尿病并发症

、

弓形虫病以及

2.

S

分子对接

将

PP

）

网络中核心靶点蛋白与活性成分进行分

子对接验证

。

核心靶点蛋白对接结果见表

9

o

一般

胰腺癌等;炎症相关通路主要包括

PLK-Akt

信号

通路、

MAPK

信号通路

、

Ray1

信号通路

、

IL

-

17

信号

通路等

。

认为进行分子对接时配体和受体的结合能越低

，

构

・

5

49

•

世界中西医结合杂志

2221

年第

4

卷第

4

期

World

Journal

of

Integrated

Trakitionai

and

Western

Me/icide

2221

,

Vol.

4

,No.

4

象越稳定

，

发生作用的可能性越大

，

若结合能

<9,

表

明配体分子均能和受体蛋白自发地结合

，

结合能

够在体外抑制

IL

-4

诱导的

HaCaT细胞血管内皮

生长因子

(VEGF

)

mRNA

及蛋白表达

，

发挥治疗银

<

-5.0

kO/moi

,

表明其结合性好

。表中的化合物

屑病的作用

[4]

o

在筛选紫草治疗银屑病的关键靶点中主要有

均能与靶点蛋白较好地结合

。

其中去氧紫草素

(DeaxysUi/onin)

与

PTGS2

结合性最好

，

结果见图

8

。

图中

DeoxysUi/oxin

与

PTGS2

活性位点

PHE

-229

形成氢键相互作用

,

这可能是促使其结合到活性位

TNF

、

EGFR

、

MMP2

、

PTGS2

等

。

靶点的主要作用集

中在炎症反应

、

免疫反应及血管损伤与增生等方

面

，

这可能是紫草发挥治疗银屑病的潜在重要途

径

。

EGFR

作为表皮生长因子受体家族的成员之

一,在细胞的生长

、

增殖和分化等生理过程发挥着

重要作用

。

此外

，

EGFR

可以激活位于细胞内的激

点的主要作用力

。

图

8

槲皮素与

PTGS2

分子对接模式图

3

讨论

中医药作为我国传统文化

，

拥有千年历史而广

受患者们的青睐

，

而中药因具有多成分

、

多途径和

多靶点协同作用的特点

，

在防治各种疑难杂症性疾

病方面具有自身的优势

。

紫草作药用始载于

《神农

本草经

》

，

属清热药中清热凉血药

，

其含有多种化学

成分,主要包括荼醌

、

苯醌

、

生物碱类

、

苯酚

、

酚酸

、

三萜酸

、

甾醇等物质

，

具有抑菌

、

抗炎

、

抗病毒

、

抗氧

化免疫调节等药理活性。

临床上紫草多为主药或

与其他中药配伍用于银屑病等多种顽固性疾病的

治疗

。

目前

，

银屑病药物普遍具有不良反应大

、

病

情反复等缺点

，

所以开发中药治疗银屑病的作用意

义重大

。

本研究通过

TCMSP

和

PuPChem数据库筛

紫草活性化合物

，

与银屑病进行靶点对接

，

构建了

药物

-

成分

-

靶点

-

疾病网络,共得到

17

个主要

活性成分

,55

个共同作用靶点以及多条主要信号通

路,从而对紫草的作用机制进行预测

。

在获得紫草活性成分中

，

IsonutyrylsUidouin

Pra-

piouyPhinouin

-

DeoxysUi/onin

-

sitosterol

等活性成分

在紫草治疗银屑病的网络结构中可能发挥着关键

作用

，

这也说明了紫草可能是通过以上化合物发挥

治疗作用

。

基于网络药理学与分子对接探讨紫草治疗银屑病的作用机制

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