2024年6月1日发(作者:)

33一 中国动物检疫2010年第27卷第2期 

猪轮状病毒GD株VP6基因的克隆及序列分析 

田小艳,邓雨修,孙华,苏润环,王东东,宋延华 

(广东省温氏集团研究院,广东新兴 527400) 

摘要:参考GenBank中发表的PRV 0SU毒株VP6基因核苷酸序列ORF两端保守区序列,设计1对特异引物,以 

PRV GD株反转录cDNA为模板,通过PCR方法扩增出长约1.4 kb的基因片段,并克隆到pMDI8-T载体中进行序列测 

定。测序结果表明:VP6基因全长1 320 bp,含有一个1194bp的开放阅读框,编码397个氨基酸。与国内外已知的l1 

个毒株VP6基因的核苷酸及其推导的氨基酸序列比较,同源性分别为76.5%一95.6%和88.7%一99.2%;核苷酸系统发育 

进化树结果表明,GD毒株与轮状病毒JL94,CN86,OSU毒株亲缘关系较近,为一个进化群。 

关键词:猪轮状病毒;VP6基因;克隆;序列分析 

中图分类号:¥852.659.4 文献标识码:A 文章编号:1005-944X(2010)02—0033—03 

se 吼I∞Amlym of VP6 G衄e of Pta' ̄i ̄Romvinm GD Stmin 

TIAN Xiao—yan,DENG Yu.xju,SUN Hua,SU Run-huan,ⅥrANG Dong.dong,SONG Yan-hua* 

(Guangdong Win’S Group Academy,Xinxing Guangdong.527400 China) 

A鼬曩cI:A pair of primers derived from the conserved region flanking the ORF of VP6 gene of porcine ro— 

tavirus(PRV)OSU strain was designed according to the published sequence.A PCR product of approximately 

1 400bp was ampliifed from cDNA of RV GD strain.The PCR product was inserted into pMD 1 8一T vector and 

sequenced.Tl1e full—length VP6gene contained 1320bp including a coding region of 1 194bp.which encodes a pro— 

te of 397 amino acids.The VP6 gene of the I GD strain shared 76.5%-95.6%homology of necleotide se. 

quences and 88.7%—,99.2%amino acids with those of ll RV strains.Tl1e results indicated that the GD isolate iS 

more similar to儿94、CN86 and OUS in gene type. 

K盯w呻dI:porcine romviru(PI );VP6 genome;cloning;sequence analysis 

轮状病毒(Rotaviru,RV)是呼 

1材料和方法 

1.5轮状病毒VP6基因的扩增 

肠孤病毒科轮状病毒属的成员,是各 

1.1 病毒 

按Trizol试剂盒说明的方法, 

种幼龄动物非细菌性腹泻的主要病 

猪轮状病毒为本实验室从广东 从病毒培养液中提取病毒基因组 

原之一[1]。我国猪轮状病毒PRV感染 

某规模化猪场分离获,猪轮状病毒从 

RNA,按10Il L反转录体系进行反转 

非常普遍,感染后,使仔猪机体免疫 

广东分离获得,病毒经KM04细胞培 录,RT—PCR反应参照试剂盒说明书进 

力急剧下降,从而诱发多种腹泻病原 

养,第6代毒用于本研究。 

行,同时设立阴阳性对照.. 

体混合感染,导致仔猪死亡率上升, 1.2载体与菌株 

1.6 PCR产物克隆与鉴定 

或生长缓慢、停滞[2]。 

pMD18一T购自Takara公司,大肠 

所得阳性扩增产物经纯化后克 

VP6是RV唯一的内衣壳蛋白,由 杆菌(DH5 a)本实验室保存。 隆到pMD18-T载体中,转化大肠杆菌 

基因片段6编码397个氨基酸,约占 

1.3试剂和工具酶 

JM109,提取质粒,经酶切和PCR鉴定 

病毒蛋白总量的51%。VP6是重要的 

Trizol试剂盒购自大连宝生物 

为阳性样品后,送往宝生物工程(大 

表位标志,具有免疫原性和抗原性, 

工程有限公司;DNA胶回收试剂盒,质 

连)有限公司测序。利用DNAStar软 

是RV的群抗原和亚群抗原,同一血 

粒快速提取试剂盒均购自美国Omega 

件对测序结果进行分析。 

清群具有共同抗原[3_5]。在A组轮状 

Bio—tek公司;DNA Marker为北京鼎 1.7 RV VP6基因序列的同源性比较 

病毒中,VP6蛋白基因在序列上具有 国生物技术有限公司产品。 用Blast和DNAStar软件对 

高度的保守性,是诊断实验中检测到 

1.4引物 

GenBank中l1株PRV的vP6全基因 

的主要抗原,所有A群轮状病毒都具 根据Genl3ank中PRV核酸序列 序列进行同源性比较,并绘制基因系 

有共同的群特异性抗原VP6[ 。 设计l对VP6片段扩增引物。引物由 

统发育进化树。 

本研究通过对PRV 6D VP6基因 上海生物工程有限公司合成。引物序 2结果 

进行分析,从基因角度分析广东省流 

列、位置及扩增片段大小见表1。 

2.1 目的基因扩增 . 

行毒株与其他毒株间的关系,为探索 

该病毒的起源,分子流行病学特征和 

表1 PRV VP6基因RT-PCR扩增引物 

抗原变异规律提供依据,也为研制疫 

苗奠定了一定的理论基础。 

面而 西 华 

n物检疫2010年第27卷第2期 ..34.. 

细胞毒中提取病毒RNA,用 

的方法扩增VP6基因,PCR产 

i' 2 3 ‘ 5 i 6 7 8 9 'O tt 12 

'■_ 9,,O 76.6 7,.7 09.2}9o.3 鲫o 87.' 8e2 79.口 ∞8 聃9 ' 

2%琼脂糖凝胶电泳分析,可见 

2{9.5 77.' 76.7 85.e I85卫 77.7 84 e 8t● 80.2 02.9 83.● 2 

3 i2e.3 27.6 87,6 76.5 l 76.5 ∞,3 77 o 76.9 7B.3 77,3 7,.e 3 

左右特异性的目的条带,大小 

●i 26 7 2e.1 '3.0 76量n.6.e ∞O ,6 2 77.4 e O 77.6 ”.e ● 

结果一致(图1)。 

5 i11 e 1簟e 2&0 2t3 I" 756 9n5 口3.O 竹' ∞3 90 5 

●{10。5 15e 2搴.● 拍.O 2■_ 79.4 ∞.9 g1 4 82.4 髑.6 09.9 ● 

I 1 2 3 4 

7 i 23 5 篇.8 '毫2 '0.7 2‘.'i24.3 ,巍O e 2 e1.8 79.8 79,8 7 

e i14.3 17.3 27.e 2g.O 1O.4}11.2 箱-0 ●瞳' 船7 ∞.0 9●-9 e 

●}13.O 17.7 2&0 272 ,5{g.4 23.2 10.8 ∞.2 ∞.2 90.O 9 

髓}23.7 2 2 25.9 23-6 19,4;2o.3 21 4 199 '9 2 I82.6 82.4 伸 

,’}148 19.7 27.● 26.粤 ’O 7{11.5 241 11.0 10.8 20.1 I 95.8 '' 

"12 l14 7 'g.1 26.6 26.5 '0.8}111 23.0 t1.3 10.g 20.3 ●.6 I"12 

l' 2 3 ● 5{● 7 8 9 伯 1t 12 

表2不同PRV毒株VP6基因相应核苷酸的同源性比较 

percerdIde岫 

}' 2 3 ‘ 5 ● 7 B 9 '1o 1t 12 

A分子质量标准;1.2:样品;3:阳 

'■_ 甜r了 8114 ∞^9 轴.5 97.2 91 O g0.o 帕O 03 97 7 97 2 ' 

osu 

4:阴性时照 

2 5.2 柚.7 9'.: 95O 932 91,2 95-8 945 97.o 9 7 113.7 2 

A411 ・ 

3 "1 ●.7 _ 95 2 e8,9 88.9 ¨7 们 4 ∞I9 9'.0 翻 2 ∞,2 3 

8223 

V VP6基因PCR产物凝胶电泳分析 

● '0e 9' 4.7 舳.2 e孽.2 955 e .7 e94 。1., ¨.● 的.4 ● 

BM33 

果 

5 '3 5.0 11 7 '1l I117.5 e 9 9孽.2 孵7 93 7 9&O 97.5 5 

CN86 

‘ 26 6拿 11.7 11 4 23 I -t5 9/'.5 97.5 g2.5 9 2 ∞, e 

CRW-¥ 

7 94 91 5 2 4.● 'ne 100 柏.5 90.5 92.0 ∞.2 9n2 7 

D0119822 Chllt● IL 

匡组质粒p ̄日)一VP6鉴定结果 

0 O.0 5.O 11.1 1O.e 0S 2.3 'n0 ●曩2 93.7 ∞_5 ∞O l 

OQ204741 ln埘● 

VP6的回收产物与与pMDI8一T 

● O.e 5.5 '1 7 ,’1 '.0 2 3 ’0.0 n5 93.2 9&O 975 ● EU3727∞ 

t0 6.g 28 tit4 e5 0.3 7.7 0.3 0.3 6.9 ∞.0 9 O 'O 

Oollfded 

接,构建了p ̄Ⅱ)一VP6重组质粒。 

'1 O 63 1'.4 '’1 1 e 2.0 10 3 '3 ’8 7.’ ∞.2 '’ 

Isolat ̄l靠咖 

质粒进行ttind III和Kpn I双 

12 2 B B.3 11.4 "1 2.3 3.1 10,3 1 B 2 3 7t O.5 _ '2 

JL94 

' 2 3 ● 5 0 7 B ● 伯 11 '2 

定,释放出长度约1400bp和 

表l3: ̄NPRV毒株VP6基因所编码氨基酸的同源性比较 

拘片段;同时PCR也扩增出 

目的片段与预期结果相符,证 

DNA Star软件将核苷酸同源性分析 

型上更为接近。而且,发现在收集的 

质粒pMD—VP6构建成功(图2)。 

结果绘制系统发育进化树,并参照国 

毒株之间核苷酸同源性差异较大,但 

内外猪轮状病毒基因分群的方法,GD 氨基酸同源性却很高,说明VP6基因 

分离株属于A群亚组I,这一结果也 

存在一定数目碱基的无意义突变,且 

一2 0

与同源性分析结果相吻合(图3)。 较为较普遍。 

isoIOted skain 

JL94 

oQ204741 lndla 

CNe6 

昆 心

竹 8∞盯”酣帕 

0 

 

EU372760 Thailand 

CRW-8 

咖 

O8U 

A411 

B223 

BRV033 

D01 19822 China 

Oolfrted 

P6基因的核苷酸序列测定以 

15 1o 5 O 

NucleoUda Substitutions 00) 

他毒株的同源性分析 

图3猪轮状病毒株系统发育进化树 

重组质粒进行序列测定,经比 

证明获得了RV VP6蛋白的全 

3讨论 

对我国猪轮状病毒地方株GD 

共1320bp,含有一个1 194bp 

轮状病毒作为腹泻的主要病原, 

VP6蛋白基因进行克隆、序列测定和 

阅读框,编码397个氨基酸。 

给世界各国的畜牧业造成严重的经 

分析,这可以为毒株鉴定提供依据, 

取GenBank上具有代表性毒 

济损失,我国猪轮状病毒感染非常普 也丰富了PRV感染的分子流行病学 

RV VP6全基因序列进行同源 

遍,VP6是病毒中含量最丰富的蛋白 资料,为进一步在分子水平研究猪轮 

结果显示(表2、表3),GD毒 质,它具有良好的抗原特异性,是很 

状病毒在广东省的流行、变异规律以 

发表的ll株国内外毒株序列 

好的诊断试剂。所有A群轮状病毒都 

及主要结构基因的特性等奠定了基 

苷酸同源性在76.5%一95.6%之 

具有共同的群特异性抗原VP6。 础,也为猪轮状病毒的诊断及防治提 

中与JL94株的同源性最高达 

本研究选用RV GD毒株对VP6 供重要的物质基础。 

与B233株的同源性最低为 

全基因序列进行核苷酸和氨基酸同 

参考文献 

氨基酸的同源性在88.7%一99. 

源性比较,基因序列分析结果表明: 

[1]殷震,刘景华.动物病毒学[M]. 

其中与DQ204741株的同源 

GD株VP6与代表株OSU株VP6(亚群 第2版.北京:科学出版社,1997. 

达98.5%,与B233株的同源性 

I)、Gottfried株VP6(亚群II)核苷 

456—466. 

89.2%。 

酸序列同源性分别为86.8%和 

[2]宣长和,孙福先,朱战波,等. 

进…步分析广东流行毒株与 82.416%,氨基酸序列同源性分别为 

猪病学[M].第2版.北京:中国农业 

株在遗传进化上的关系,用 97.7%和93%,GD株与OSU株在基因 

(下转第4l页) 

4l一 中国动物检疫2010年第27卷第2期 

到组织中去,袁科平在对磺胺甲嗯唑 

相关国家或组织严格监控的药物品 

复方新诺明在鲈鱼体内的药物代谢 

在罗非鱼体内的药动学研究中也发 

种之一,FDA、欧盟及我国农业行业标 

动力学研究[J].海洋科学,2001, 

现有这种现象嘲。在本试验中,肝脏、 准(NY5070—2002)规定动物源食品中 

25(2):35—38.。 

血液和肌肉的消除速率常数Ke分别 

磺胺药的最大残留限量为0.1mg/ 

[8]袁科平,艾晓辉.磺胺甲噫唑在 

为0.14/h、0.035/h和0.031/h,SM, 

kg;日本为不得检出。黑鲳肌肉作为 

罗非鱼体内的药代动力学及组织浓 

在肝脏中的消除速率常数远大于血 

可食性组织,若以0.1mg/kg残留标 

度研究[J].水利渔业,2008,28 

液和肌肉,这与肝脏作为主要的代谢 

准,在(2O±2)℃水温条件下以《中华 

(3):25-27. 

器官相一致。药物消除半衰期 

人民共和国水产行业标准.磺胺类药 [9]方星星.复方新诺明和恩诺沙 

(T1/2)是衡量药物在某种动物体内 

物水产养殖使用规范》推荐剂量口服 星在两种水产动物体内药代动力学 

消除速率的一个重要的固定常数,它 

磺胺二甲嘧啶的休药期为14d,肝脏 

及残留研究[D].中国海洋大学研究 

只受药物本身性质的影响,而与药物 

中休药期为15d。由于动物年龄、健康 

生学位论文.青岛:中国海洋大学, 

的给与浓度无关[12]。研究表明,同一 

状况、水温、水质等条件均可影响药 

2003. 

种药物在不同的动物体内的消除半 物的消除速率,尤其是温度条件,对 [1O]杨秀娟,张曦.磺胺二甲嘧啶残 

衰期是不同的,在恒温动物体内的消 

水生动物体内的药物代谢消除影响 留检测方法的研究进展[J].动物食 

除速度较快,而在变温动物体内的消 非常显著,因此在现实生产中要根据 

品与安全,2004,(儿):17—18. 

除速度则明显减缓[13]。磺胺二甲嘧啶 药物使用情况和实际养殖条件灵活 

[11]袁宗辉.磺胺药的比较代谢研 

在东北细毛羊体内的血浆消除半衰 

把握休药期。 

究[J].中国兽药杂志,2001,35(5): 

期为(4.6635±1.53)h,奶山羊的血 

参考文献 

46—51. 

浆消除半衰期为(4.74±1.29)h[川, [1]张海琪,宋刑刑,徐晓林,等. 

[12]丁兴宇,刑孔庚,李琼才等. 

星布罗鸡的的血液消除半衰期为 液相色谱一串联质谱法同时测定大 三个参数对临床用药的指导意义 

(7.6573±1.8712)h[15],猪的T1/2为 

黄鱼中20种磺胺类药物残留[J]. [J].药物数理杂志,2000,13(3) 

:248—249. 

(15.32±1.44)h[,63,银鲫的血浆消除 分析化学,2007,35(2):268—272. 

半衰期为12.961h[ ̄1。而本文研究结 

[2]侯晓林,沈建忠,张素霞.鱼 

[13]杨先乐,湛嘉,康继韬.氯霉 

果表明磺胺二甲嘧啶在黑鲳血液中 肌肉中磺胺二甲嘧啶及其代谢产物 

素在罗非鱼体内的代谢和消除规律 

的消除半衰期为19.97h,消除速率较 的高效液相色谱法测定[J].畜牧兽 

[J].水生生物学学报,2005,29(3), 

266—271. 

恒温动物缓慢。SM 在不同动物机体 

医学报,2005,36(3):288—291. 

内消除速度存在的差异可能与物种 

[3j JoelEH,RichardDL,RoseMN, 

[14]孙长勉,于连智,张德新,等. 

quid Chromatographic determi- 

磺胺二甲嘧啶在东北细毛羊体内的 

的进化程度有关,较高等的动物有较 

et a1.Li

发达的药物排泄系统和器官,也有着 

nation ofSulfametbazine in Feed【J】.J 

代谢动力学研究[J].沈阳农业大学 

完善的药物消除机制,进入体内的药 

A 

学报,2001,32(1):48—50. 

O A C,1988,71(5):1054—1056. 

物可以通过肾脏进行主动消除,而使 [4]庄稼,迟燕华,李克安等.茜 [15]赵秀然,李爱华,张渊魁.磺 

SM'的消除速度明显加快;而较低等 

素红S与蛋白质的反应机理研究 

胺二甲嘧啶(SM2)在星布罗鸡体内代 

的水生动物则只能通过不完善的器 

[J].化学学报,1998,56(8):827— 

谢动力学的探讨[J].江西农业大学 

 

官对药物进行被动消除Ⅱ ,因此消除 

832.

学报,1986,8(4):55—60. 

速率相对缓慢;SM2在黑鲳血液中的 [5]李佐卿,倪梅林,俞雪钧,等.液 [16]陈杖榴,卢光志,刘建新.磺 

消除半衰期大于在银鲫血液中的消 相色谱一串联质谱法检测水产品中 胺二甲嘧啶在猪体内的代谢动力学 

除半衰期,这可能与黑鲳是一种冷水 磺胺类和喹诺酮类药物残留[J].分 研究.华南农业大学学报[J],1988, 

3):46—50. 

性鱼类有关。通常水温每升高1℃,鱼 析测试学报,2007,26(4):508—510. 

9(

 J F M,Grondel J L, 

类的代谢和消除速度将提高10%,黑 

[6]艾晓辉,陈正望.磺胺二甲嘧 

[17]Nouws

netics 

鲳生长环境温度较低,因此代谢会比 

啶在银鲫体内的药动血及组织残留 

SchuRe A R,et a1.Pharmacoki

loxaeinin carp,African catfish 

较缓慢。 

研究[J].淡水渔业,2001,31(6): 

ofciprof

52—54. 

3.2磺胺二甲嘧啶休药期的确定 

and rainbow trout[J】.Vet—Quart. 

 

磺胺类药物是FDA、欧盟、日本等 [7]王群,孙修涛,刘德月,等. 

1988.t0:2l1.216.

(上接第34页) 

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