2024年4月15日发(作者:)
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丙氨酸
精氨酸
Alanine
Arginine
A 或 Ala 89.079 CH 3 -
R 或 Arg 174.188
脂肪族类
HN=C(NH 2 )-NH-(CH 2 ) 碱性氨基酸
3 - 类
酰胺类
酸性氨基酸
类
含硫类
酰胺类
酸性氨基酸
类
脂肪族类
天冬酰胺 Asparagine N 或 Asn 132.104 H 2 N-CO-CH 2 -
天冬氨酸
Aspartic
acid
D 或 Asp 133.089 HOOC-CH 2 -
C 或 Cys 121.145 HS-CH 2 -
Q 或 Gln 146.131 H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 -
E 或 Glu 147.116 HOOC-(CH 2 ) 2 -
G 或 Gly 75.052 H-
H 或 His 155.141
I 或 Ile
半胱氨酸 Cysteine
谷氨酰胺 Glutamine
谷氨酸
甘氨酸
组氨酸
Glutamic
acid
Glycine
Histidine
N=CH-NH-CH=C-CH 2 - 碱性氨基酸
|__________| 类
脂肪族类
碱性氨基酸
类
含硫类
芳香族类
亚氨基酸
羟基类
羟基类
异亮氨酸 Isoleucine
亮氨酸
赖氨酸
蛋氨酸
苯丙氨酸
脯氨酸
丝氨酸
苏氨酸
色氨酸
酪氨酸
缬氨酸
Word 文档
131.160 CH 3 -CH 2 -CH(CH 3 )- 脂肪族类
Leucine
Lysine
L 或 Leu 131.160 (CH 3 ) 2 -CH-CH 2 -
K 或 Lys 146.17 H 2 N-(CH 2 ) 4 -
Methionine M 或 Met 149.199 CH 3 -S-(CH 2 ) 2 -
Phenylalanin
F 或 Phe 165.177 Phenyl-CH 2 -
e
Proline
Serine
Threonine
P 或 Pro 115.117
-N-(CH 2 ) 3 -CH-
|_________|
S 或 Ser 105.078 HO-CH 2 -
T 或 Thr 119.105 CH 3 -CH(OH)-
Tryptophan W 或 Trp 204.213
Tyrosine
Valine
Phenyl-NH-CH=C-CH 2 -
芳香族类
|___________|
芳香族类
脂肪族类
Y 或 Tyr 181.176 4-OH-Phenyl-CH 2 -
V 或 Val 117.133 CH 3 -CH(CH 2 )-
.
与核苷酸序列相关的特征关键词表
关键词 说明
allele 相关的个体或菌株含有相同基因的稳定的其它形式,该形式区别于这一位置的现
有的序列(和或许其它序列)
attenuator 存在调节转录的终止的DNA区域,它控制了一些细菌操纵子的表达; (2)位于启动
子和第一个结构基因之间,引起转录的部分终止的序列区段
C_region 免疫球蛋白轻和重链的恒定区,和T-细胞受体α,β,和γ链;根据特定的链可包括一
个或多个外显子
CAAT_signCAAT盒;位于可能参与RNA聚合酶结合的真核生物转录单位的起始点的75bp
al 上游的保守序列的一部分;共有序列=GG(C或T)CAATCT
CDS 编码序列;对应于蛋白质中的氨基酸序列的核苷酸的序列(位置包括终止密码子);
特征包括氨基酸概念上的翻译
Conflict 在这一位点或区域,单独确定的“相同”序列有所不同
D-loop 置换环;线粒体DNA内的一个区域,其中RNA的短的序列与DNA的一条链配
对,代替了这一区域的原始配对DNA链;也用于说明在RecA蛋白质催化的反应
中,侵入的单链替代双链DNA的一条链的区域
D-segmen免疫球蛋白重链的多变区,和T-细胞受体的β链
t
Enhancer 顺 式-作用序列,它增强了(一些)真核生物启动子的作用,并能在任一方向和与启
动子相关的任何位置处 (上游或下游)起作用
Exon 编码剪接mRNA部分的基因组区域;可以含有5'UTR,所有CDS,和3'UTR
GC_signal GC盒;位于真核生物转录单位起始点上游的保守的富含GC区域,可以以多重拷
贝或任一方向存在;共有序列=GGGCGG
gene 鉴定为基因的生物学意义的区域,并已经指定名称
iDNA
intron
间插DNA;通过几种重组中的任何一种能被消除的DNA
被转录的DNA区段,但通过同时剪接位于其两侧的序列(外显子)即可从转录本内
部将其除去
J_segment 免疫球蛋白轻链和重链的连接区段,和T-细胞受体α,β和γ链
LTR 长的末端重复,在确定序列的两端直接重复的序列, 类型典型地见于逆转录病毒
中
mat_pepti成熟的肽或蛋白质的编码序列;翻译后修饰之后成熟的或最终的肽或蛋白质产物
de 的编码序列;位置不包括终止密码子(与相应的CDS不同)
misc_bindi不能用任何其它Binding关键词(primer_bind或protein_bind)表述的与另一个
ng 组成成分共价或非-共价结合的核酸中的位点
misc_differ特征序列与记载中存在的有所不同,并且不能用任何其它不同关键词
ence (conflict,unsure,old_sequence,mutation,variation,allele或modified_base)
表述
misc_featu不能用任何其它的特征关键词表述的具有生物学意义的区域;新的或少见的特征
re
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