2024年4月18日发(作者：)

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Clustalx 多重序列比对图解教程(By Raindy)

本帖首发于Raindy'blog,转载请保留作者信息，谢谢！欢迎有写生物学软件专

长的战友，加入生信教程写作群：，接头暗号：你所擅长的生物学软件名称

软件简介:

CLUSTALX－是CLUSTAL多重序列比对程序的Windows版本。Clustal X为进

行多重序列和轮廓比对和分析结果提供一个整体的环境。

序列将显示屏幕的窗口中。采用多色彩的模式可以在比对中加亮保守区的特

征。窗口上面的下拉菜单可让你选择传统多重比对和轮廓比对需要的所有选项。

主要功能：

你可以剪切、粘贴序列以更改比对的顺序；

你可以选择序列子集进行比对；

你可以选择比对的子排列(Sub-range)进行重新比对并可插入到原始比对

中；

可执行比对质量分析，低分值片段或异常残基将以高亮显示。

当前版本:1.83

PS:如果你是新手或喜欢中文界面,推荐使用本人汉化的Clustalx 1.81版

链接地址::ist&ID=7435 (请完整复制)

应用:Clustalx比对结果是构建系统发育树的前提

实例：植物呼肠孤病毒属外层衣壳蛋白P8(AA序列)为例

流程：载入序列―>编辑序列―>设置参数―>完全比对―>比对结果

1.载入序列：运行ClustalX，主界面窗 口如下所图（图1），依次在程序

上方的菜单栏选择“File”－“Load Sequence”载入待比对的序列，如图2所

示，如果当前已载入序列，此时会提示是否替换现有序列(Replace existing

sequences)，根据具体情形选择操作。

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图1