2024年4月20日发(作者:)
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54—-—— 江苏农业科学2012年第40卷第4期
王文涛,鑫淼,张冬杰,等. £曰基因在360日龄野家杂交猪不同组织中的表达[J].江苏农业科学,2012,40(4):54—55
Cst B基因在360日龄野家杂交猪不同组织中的表达
王文涛,鑫淼,张冬杰,刘娣
(黑龙江省农业科学院畜牧研究所,黑龙江哈尔滨150086)
摘要:采用RT—PCR技术,对Cst B基因在360日龄野家杂交猪心肌、肝脏、胃、肾脏、肺、大肠、小肠、背肌和腿肌
等组织中的表达情况进行了分析研究。结果表明,Cst B基因在360日龄野家杂交猪小肠中有较高的表达,在其他组
织中的表达量相对较低。
关键词:猪;RT—PCR;Cst B基因;组织表达
中图分类号:Q786 文献标志码:A 文章编号:1002—1302(2012)04—0o54-02
Cst B是半胱氨酸蛋白酶抑制剂家族I(cystatin)成员之
一
…
,
cystatin是溶酶体半胱氨酸蛋白酶(如组织蛋白酶B、H、
1材料与方法
1.1材料
L和S等)的内源性抑制剂,由一个大的超家族组成,包括A、
B、C等数种 J。Cystatin B(又称steifn B,STFB)主要抑制组
织蛋白酶L,通过控制细胞内溶酶体蛋白酶的活性从而调控
DNA Marker DI2000、4种脱氧核苷酸(dNTP)、rTaq DNA
聚合酶购自大连宝生物工程有限公司;琼脂糖(Agamse,西班
牙);TRIZOL Reagent购自Invitrogen公司;引物合成和PCR
蛋白转换和酶原、激素原的加工 。Cst B基因在人类中已经
得到全序列,含有3个外显子、2个内含子,Cds全长297 bp,3
个外显子的长度分别为66、102、129 bp 。Cst B基因在猪上
产物克隆测序由上海英俊生物技术有限公司完成。供试样本
采自黑龙江省伊春市爱林林场(360日龄野家杂交猪)。
1.2方法
的研究获得了全Cds序列,其中3个外显子长度分别为66、
99、102 bp。
取360日龄野家杂交猪各个组织样品,TRIzol法提取总
RNA,2%琼脂糖电泳验证RNA的完整性,并用光密度读取
D 与D 。 ,检测RNA质量,计算RNA浓度。
野猪又名山猪,是偶蹄目猪科猪属之一。野猪膘肥体壮,
四肢粗短,头部较长,耳小并直立,吻部突出似圆锥体,它的顶
端为裸露的软骨垫(拱鼻);每脚有四趾,俱为硬蹄,仅中间两
趾着地;尾细短;犬齿发达,雄性上犬齿外露,并向上翻转,呈
獠牙状;野猪耳披有刚硬而稀疏的针毛,背脊鬃毛较长而硬;
根据GenBank上提供的序列设计引物(表1)。PCR反应
条件如表2。
对360日龄野家杂交猪的心肌、肝脏、胃、肾脏、肺、大肠、
小肠、背肌和腿肌组织的Cst B和口一actin基因的表达量进行
整个体色棕褐或灰黑色,因地区而略有差异。野家杂交猪是
用野猪与家猪进行杂交所产的杂交猪及其所产的后代。本研
究利用RT—PCR技术,对Cst B基因在360日龄野家杂交猪
的心肌、肝脏、胃、肾脏、肺、大肠、小肠、背肌和腿肌组织中表
达情况进行研究,表现为Cst B基因在不同组织中的表达
差异 。
收稿日期:2011—08一O1
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项(编号:CARS一36)
作者简介:王文涛(1981一),男,硕士研究生,研究方向为动物遗传育
种与繁殖。E—mail:wangwentao_1981@163.corn。
通信作者:刘娣,女,教授,博士生导师,研究方向为分子生物学。
Tel:(o451)87502330。
了分析。为了确定扩增循环数没有进入平台期,首先利用反
转录反应的产物为模板进行PCR线性增长试验,即在其他条
件相同的情况下,PCR反应循环数设为不同的值。反应结束
后在相同的琼脂糖凝胶上电泳,根据凝胶图像分析结果,以循
环数为横坐标,积分光密度(IOD)的对数值(1glOD)为纵坐
标,用Excel软件绘制PCR产物增长的折线图。根据检测结
果确定反应的循环数。
采用1%琼脂糖凝胶电泳,分别取口一actin基因和Cst B
基因的PCR产物各5 电泳, 曰基因和卢一actin基因的
PCR产物点在同一块胶上。电泳结束后用Bio—Rad公司的
Quantity—One软件以光密度吸收测定法进行目的基因表达
的定量分析。
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王文涛等: 曰基因在360日龄野家杂交猪不同组织中的表达 一55一
舛环舛环
℃
℃
n O
℃
℃
n O
表2 PCR反应条件
从图2可以看出, £日基因在360日龄野家杂种猪的小
基因
Cst B
PCR反应条件
∞℃如℃
℃寸-℃ .胁 舛.眦
肠中有较高的表达,其他组织表达量相对较低。
3讨论
8一actin
℃ ℃
髋 畦
半胱氨酸蛋白酶抑制剂家族成员广泛分布在不同类型的
细胞和组织中,并且被认为是最重要的体细胞组织蛋白酶抑
如 如
2结果与分析
℃ ℃
2.1总RNA的提取和检测
∞ ∞
TRIzol法提取的总RNA在2%普通琼脂糖凝胶电泳结果
见图1。图1中显示的3条带分别为28S、18S、
个 个
5S,条带清晰
明亮,表明RNA提取成功。
循 循
图1 组织总RNA电泳圈
2.2循环参数的确定
半定量RT—PCR技术中,目的基因与内源对照的比较应
该在PCR扩增产物增长的对数生长期进行,为防止目的基因
或 一actin基因的PCR扩增到达平台期,在进行基因表达定
量前,首先应该分别建立目的基因与内源对照基因PCR扩增
循环参数,当循环数为27次时,产量呈线性增加,因此,扩增
各个组织中Cst B基因采用27个循环数即可。
2.3 Cst B基因在360日龄野家杂交猪各组织中的表达
采用半定量RT—PCR方法检测CstB基因在360日龄野
家杂交猪的心肌、肝脏、胃、肾脏、肺、大肠、小肠、背肌和腿肌
组织中表达情况,结果见图2。
CstB p.actin
O.5
0.4
0.3
。一2
0.1
0
:几r]厂1 r]n r] 厂]r]
心肝胃肾肺大肠小肠背肌腿肌
器官
图2 CstB基因在各组织中的RT—PCR结果
制剂。干制火腿的极度松软与其加工过程中的高蛋白酶解水
平有关,并表现出其他一些缺点,如黏性咀嚼、颜色发黑、有涩
味和金属味、长期的酪氨酸结晶以及在切口表面形成的白色
膜状物。在火腿的加工过程中,蛋白质的降解大部分都是由
肌质和肌浆中的溶酶体蛋白酶催化的 ,这些溶酶体蛋白酶
的主要代表是组织蛋白酶B、H、L和D,这些酶在猪的成熟阶
段都是有活力的,然而半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatins)可
能降低这些酶的功能 。
本研究发现在360日龄野家杂交猪肌肉组织中,Cst B基
因在背肌和腿肌中表达量相对较低,而背肌中的表达量显著
高于腿肌的表达量。从蛋白酶水解的角度来说,利用360日
龄野家杂交猪背肌和腿肌制作的火腿品质相对较低,而利用
背肌制作的火腿品质高于腿肌制作的火腿。本研究结果为进
一
步研究Cst B基因与肉质的相关性、调控猪肌肉组织生长
发育、猪屠宰后新鲜肌肉中蛋白酶活力和陈酿的火腿中蛋白
酶解水平的关系等机理提供依据。
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