2024年5月30日发(作者:)

密度聚类dbscan原理及代码实现

密度聚类(Density-Based Spatial Clustering of Applications

with Noise,DBSCAN)是一种基于密度的聚类算法,它能够将具有

相似密度的数据点聚集成簇,并能够有效处理噪声数据。本文将介

绍DBSCAN的原理及其代码实现。

一、DBSCAN的原理

DBSCAN算法通过定义密度直达(directly density-reachable)、

密度可达(density-reachable)和密度相连(density-connected)

等概念,来刻画数据点之间的关系。基于这些关系,DBSCAN算法将

数据点分为核心对象、边界对象和噪声对象三类,并最终将核心对

象组成聚类簇。

1.1 核心对象、边界对象和噪声对象

在DBSCAN算法中,核心对象是指在给定半径ε内至少包含MinPts

个数据点的数据点。边界对象是指在给定半径ε内包含少于

MinPts个数据点的数据点,但它是核心对象的邻居。噪声对象是指

既不是核心对象也不是边界对象的数据点。

1.2 密度直达、密度可达和密度相连

在DBSCAN算法中,如果数据点p到数据点q之间存在一条由核心对

象构成的直接路径,并且q是p的ε-邻域内的点,则称p到q是

密度直达的关系。如果存在一个数据点序列p1, p2, ..., pn,使

得p1 = p,pn = q,并且pi+1是pi的ε-邻域内的点,则称p到

q是密度可达的关系。如果存在一个核心对象o,使得p和q都是o

的密度可达对象,则称p和q是密度相连的关系。

1.3 DBSCAN算法流程

DBSCAN算法的流程如下:

1)选择一个未被访问的数据点p;

2)如果p是一个核心对象,则以p为种子点进行扩展,找到所有p

的ε-邻域内的密度可达对象,将它们添加到一个新的簇中;

3)如果p是一个边界对象,则将其标记为噪声对象;

4)重复步骤1和步骤2,直到所有的数据点都被访问过。

二、DBSCAN的代码实现

下面是一个使用Python语言实现的DBSCAN算法的示例代码:

```python

import numpy as np

def dbscan(data, eps, min_pts):

# 初始化标签数组,-1表示未分类,0表示噪声点

labels = [-1] * len(data)

cluster = 0

for i in range(len(data)):

# 如果该点已经被分类,则跳过

if labels[i] != -1:

continue

# 获取该点的ε-邻域内的点的索引

neighbors = get_neighbors(data, i, eps)

# 如果该点为核心对象

if len(neighbors) >= min_pts:

cluster += 1

labels[i] = cluster

expand_cluster(data, labels, i, neighbors, eps,

min_pts)

# 如果该点为边界对象

else:

labels[i] = 0

return labels

def expand_cluster(data, labels, core_point, neighbors, eps,

min_pts):

for neighbor in neighbors:

# 如果该点未被访问过

if labels[neighbor] == -1:

labels[neighbor] = labels[core_point]

new_neighbors = get_neighbors(data, neighbor,

eps)

# 如果该点也是核心对象,则扩展种子点

if len(new_neighbors) >= min_pts:

(new_neighbors)

def get_neighbors(data, point, eps):

neighbors = []

for i in range(len(data)):

# 计算点之间的欧氏距离

if (data[point] - data[i]) <= eps:

(i)

return neighbors

# 测试代码

data = ([[1, 1], [1, 2], [2, 1], [4, 7], [5, 5], [5,

6], [6, 5], [10, 8], [10, 9], [11, 8]])

eps = 2

min_pts = 3

labels = dbscan(data, eps, min_pts)

print(labels)

```

以上代码实现了一个简单的DBSCAN算法,用于对一个二维数据集进

行聚类。输入的数据集为一个numpy数组,eps表示邻域的半径,

min_pts表示邻域内最少的点数。输出的labels数组表示每个数据

点所属的簇的标签,-1表示噪声点,大于0的整数表示簇的编号。

三、总结

DBSCAN是一种基于密度的聚类算法,它能够将具有相似密度的数据

点聚集成簇,并能够有效处理噪声数据。本文介绍了DBSCAN的原理

及其代码实现,通过定义核心对象、边界对象和噪声对象,以及密

度直达、密度可达和密度相连的关系,实现了一个简单的DBSCAN算

法。希望通过本文的介绍,读者能够对DBSCAN算法有更深入的理解,

并能够灵活运用该算法进行聚类分析。