2024年4月27日发(作者：)

2012-2-8序列拼接软件使用总结：

1. 目前，个人使用DNAstar较Vector NTI更顺手。

可能因为vector中某些设置没有调整，assemble后的序列中存在许多N，需人为删除。

且在DNAstar中可随意将碱基编辑为Y，R，S等兼并碱基，而在Vector中无法进行同样操

作，键盘输入兼并碱基时只能显示出N。

更重要的一点是，在contig中选中某一位碱基想细看时，标记不明显，上下几排碱基只有

两条细细的白边来标示，要仔细分辨才能保证不会看错位。

白边在旁边这两条红

线内侧，万分仔细看才

能看见-__-b

对比一下，DNAstar中的界面多醒目啊：

1

2

BTW: icon 1 can be used to amplify chromatogram. Icon 2 can be used to show/hide

chromatogram.

2. 使用DNAstar时偶尔会出现无法拼接成一条序列的情况，比如本来有5个片断，导入所有片

断后assemble，却分成了2个contig：1-3为一个contig，4和5拼成另一个contig。此

时可先将3和4的序列进行assemble，然后再选择Sequence〉Add…将其他序列加入，再拼

接，就会生成一条contig了。

3. Vector亦有其特色，例如:

(1)可以在同一窗口中直接看到某一拼接序列位于整个序列的什么位置：